Był sekretarzem i przewodniczącym kilku konferencji, w tym międzynarodowych, członkiem Rady Naukowej IBIB, Komitetu Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej PAN. Pełnił funkcję kierownika Katedry Inżynierii Biomedycznej WETI PG, prodziekana ds. badań WETI PG (2012–2016) oraz dziekana WETI PG (2016–2020). W latach 2010–2012 pełnił funkcję prorektora ds. nauki w Olsztyńskiej Wyższej Szkole Informatyki i Zarządzania im. Tadeusza Kotarbińskiego. Wieloletni przewodniczący Oddziału Gdańskiego Polskiego Towarzystwa Fizyki Medycznej.
Dorobek naukowy Działalność naukowa prof. Wtorka i współpracowników skupiona jest na nieinwazyjnych metodach oceny układu krążenia, elektrycznych (aktywnych i pasywnych) właściwości tkanek, spektroskopii impedancyjnej oraz inteligentnego otoczenia.
Prof. Jerzy Wtorek współpracuje z wieloma zagranicznymi jednostkami naukowymi (Finlandia, Belgia, Niemcy, Hiszpania), na których spędził przeszło dwa lata. Był wykładowcą i prorektorem Olsztyńskiej Wyższej Szkoły Informatyki i Zarządzania im. prof. Tadeusza Kotarbińskiego. Jest autorem i współautorem ponad 220 opublikowanych doniesień konferencyjnych i artykułów w czasopismach oraz około 20 patentów.