Od momentu powstania ECSO koordynuje organizację nowych kongresów, które odbywają się (średnio) co drugi rok i za każdym razem gospodarzem jest inna organizacja członkowska. Lista Europejskich Kongresów Sceptyków: Wydarzenie Data Miasto Kraj Uwagi1 Europejski Kongres Sceptyków 5–7 maja 1989 Bad Tölz 23x23px|link=|alt=|tło Niemcy Zachodnie2 Europejski Kongres Sceptyków 10–11 sierpnia 1990Bruksela 23x23px|link=|alt=|tło Belgia3 Europejski Kongres Sceptyków 4–5 października 1991 Amsterdam 23x23px|link=|alt=|tło Holandia4 Europejski Kongres Sceptyków 17–19 lipca 1992 Saint-Vincent 23x23px|link=|alt=|tło Włochy5 Europejski Kongres Sceptyków 29–31 sierpnia 1993 Keele 23x23px|link=|alt=|tło Wielka Brytania Temat: „Nauka dla życia: zdrowie, medycyna i dobre samopoczucie”.