II runda kwalifikacyjna Do startu w II rundzie kwalifikacyjnej uprawnione były 34 drużyny (5 z poprzedniej rundy), z czego 17 było rozstawionych. Losowanie odbyło się 19 czerwca. Pierwsze mecze rozegrano w dniach 11–12 lipca, natomiast rewanże odbyły się tydzień później (18-19 lipca).
Uwaga: Losowanie II rundy kwalifikacyjnej odbyło się przed zakończeniem I rundy, więc rozstawienia dokonano przyjmując założenie, że awans uzyska drużyna z wyższym współczynnikiem w poprzedniej rundzie.
drużyny, które awansowały z I rundy kwalifikacyjnej
Grupa 1 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. Red Bull Salzburg 40,570 Łudogorec Razgrad 34,175 APOEL Nikozja 26,210 Qarabağ FK 18,050 Partizan Belgrad 16,075 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. Žalgiris Wilno 5,825 F91 Dudelange 4,975 Budućnost Podgorica 3,300 Hibernians2,800 SK Samtredia 1,525
Grupa 2 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. FC Kopenhaga 40,570 BATE Borysów 29,475 FK Astana 16,800 HNK Rijeka 15,550 Sheriff Tyraspol 11,150 Hapoel Beer Szewa 10,875 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. MŠK Žilina 5,850 The New Saints F.C. 5,775 Kukësi 4,575 Budapest Honvéd FC 3,175 Alaszkert 2,525 Spartaks Jūrmala 1,975