Między 18 września do 28 grudnia 1939 roku był komendantem obozów żołnierskich w rejonie Babadag, następnie w obozach oficerskich Călimănești, Târgoviște w Rumunii. Od 29 grudnia 1939 do 27 marca 1940 roku pracował w Attaché wojskowym w Bukareszcie i zajmował się tam pracami specjalnymi, czyli ewakuacją żołnierzy polskich do Francji.
Po wybuchu II wojny światowej przedostał się na Zachód do Wielkiej Brytanii i wstąpił do Polskich Sił Powietrznych w Anglii w ramach Royal Air Force. Otrzymał numer służbowy RAF P-1519. Został szefem powołanego 1 października 1941 roku Biura Historycznego Lotnictwa. Służbę zakończył w stopniu podpułkownika i wing commandera.
Po zakończeniu wojny pozostał na emigracji w Wielkiej Brytanii. Zmarł 4 marca 1973 roku. Został pochowany w Newton Abbot. Symboliczna tablica nagrobna umieszczona została przez rodzinę na grobie Haberków i znajduje się na cmentarzu komunalnym w Bieczu.
Upamiętnienie Jego postać pojawia się w książkach: Z kabiny obserwatora Janusza Kędzierskiego oraz w cyklu Janusza Meissnera Wspomnienia pilota.