Na działanie enzymu CYP3A4 praktycznie nie wpływa.
Nie stwierdzono farmakokinetycznej interakcji sertraliny z alkoholem, aczkolwiek nie zaleca się spożywania alkoholu podczas terapii (dotyczy to zresztą wszystkich niemal leków). Potencjalnie, etanol może wzmóc metabolizm sertraliny poprzez indukcję enzymu CYP2B6.
Należy zasięgnąć porady lekarza jeśli pacjent przyjmuje: inhibitory monoaminooksydazy (jak np. selegilina lub fenelzyna) – mogą wystąpić poważne reakcje prowadzące nawet do zgonu, dlatego należy odczekać co najmniej 2 tygodnie od przyjęcia ostatniej dawki inhibitora MAO inne leki z grupy SSRI (po odstawieniu większości należy odczekać co najmniej kilka dni, a po odstawieniu fluoksetyny (Prozac, Andepin) – nawet 5–7 tygodni) leki z grupy TLPD (po odstawieniu większości należy odczekać co najmniej kilka dni) pimozyd – lek stosowany w schizofrenii i psychozach dekstrometorfan – lek na kaszel petydynę, tramadol – leki przeciwbólowe o właściwościach serotoninergicznych (ryzyko wystąpienia drgawek lub zespołu serotoninowego) węglan litu stosowany w chorobie afektywnej dwubiegunowej sumatryptan – stosowany w migrenowych bólach głowy niesteroidowe leki przeciwzapalne (ibuprofen, diklofenak, kwas acetylosalicylowy, dipirydamol, tyklopidyna) – mogą powodować krwawienie warfaryna – lek rozrzedzający krew tolbutamid –