W ofercie było ponad 300 000 połączeń dziennie.

Przewozy kolejowe mały|FlixTrain na stacji Hamburg-Altona mały|Wagon FlixTrain

W ramach przedsiębiorstwa Flix oferowane są także przewozy kolejowe na terenie Niemiec oraz Austrii. Pierwszym połączeniem kolejowym w ofercie przedsiębiorstwa była trasa Wien Westbahnhof – Sankt Pölten – Linz – Salzburg, na której przewozy wykonuje przedsiębiorstwo Westbahn. Kolejnym etapem było przejęcie w 2017 roku niemieckiego przewoźnika kolejowego Locomore, który w 2017 roku ogłosił upadłość. Stało się to we współpracy z czeskim przedsiębiorstwem kolejowym Leo Express. W ten sposób 23 marca 2018 roku na niemieckie tory wyjechały pociągi pod marką FlixTrain na trasie Berlin-Lichtenberg – Hanower – Kassel – Frankfurt – Stuttgart. Jednocześnie doszło do włączenia w siatkę pociągów na trasie Hamburg-Altona – Osnabrück – Essen – Düsseldorf – Kolonia, które obsługuje przewoźnik Bahn-Touristik-Express. Miesiąc później uruchomiono także nocne połączenie kolejowe na trasie Hamburg – Hanower – Freiburg – Lörrach.