Szczególnym momentem było przewiezienie relikwii matki Urszuli z Rzymu do Pniew w maju 1989 roku i złożenie ich w sarkofagu 30 maja 1989 roku. Sarkofag znajduje się w bocznej nawie kaplicy domu macierzystego. W dniu 9 grudnia 2003 roku abp Stanisław Gądecki, metropolita poznański, nadał temu miejscu status sanktuarium diecezjalnego archidiecezji poznańskiej. Z tego tytułu kaplica Sanktuarium św. Urszuli była świątynią jubileuszową w ramach Roku Życia Konsekrowanego i Roku Miłosierdzia.
W skład Sanktuarium wchodzą: kaplica i sarkofag z relikwiami św. Urszuli, cela, w której mieszkała i pracowała św. Urszula, pokój pamiątek związanych z życiem i działalnością św. Urszuli, wystawa poświęcona życiu i działalności św. Urszuli, figura św. Urszuli na dziedzińcu, pamiątka beatyfikacji, Dom Matki Założycielki z aulą i wystawą, zabudowania domu macierzystego, dom pielgrzyma św. Anieli. Na terenie Sanktuarium znajduje się również szkoła – Zespół Szkół Sióstr Urszulanek SJK w Pniewach. Jest to dzieło zainicjowane przez św. Urszulę w 1920 roku jako Szkoła Gospodarcza.