Kolejną szczepionką którą Plotkin wyprodukował wspólnie z H. Fred Clarkiem i Paulem Offitem, była szczepionka przeciwko rotawirusom. W 2006 roku, szczepionka tej grupy naukowców stała się częścią zalecanego przez Stany Zjednoczone kalendarza szczepień. W roku 1970 Plotkin przewodniczył przy rozwoju eksperymentalnej szczepionki przeciwko cytomegalowirusowi (CMV). Szczepionka ta, wyprodukowana korzystając z osłabionych wirusów, jeszcze nie jest w komercyjnej produkcji.
Inne zajmowane stanowiska 1956: staż, Cleveland Metropolitan General Hospital 1957: oficer, Epidemic Intelligence Service, United States Public Health Service 1959–1973: instruktor, później profesor nadzwyczajny, School of Medicine, University of Pennsylvania 1961: lekarz rezydent, Children’s Hospital of Philadelphia 1962-1963: lekarz rezydent, Hospital for Sick Children London 1964: stypendysta Joseph P. Kennedy Jr.