Przez władze emigracyjne został pośmiertnie awansowany do stopnia kapitana i odznaczony Krzyżem Walecznych nr 29875 (opracowano na podstawie List starszeństwa piechoty oraz książki Zdzisława Ciesielskiego – „Dzieje 14 Pułku Piechoty w latach 1918–1939”).). 19 września 1939 dostał się do niemieckiej niewoli, którą spędził w oflagach: IV A HohnsteinW części źródeł wskazano, że pierwszym obozem, w którym przebywał kpt. Fabijanowski, był oflag IX A Spangenberg., II A Prenzlau (przebywał w nim do dnia 14 listopada 1940) i II C Woldenberg.
Okres powojenny Po wyswobodzeniu z niewoli powrócił do Polski. Był długoletnim pracownikiem Łódzkich Zakładów Wytwórczych Kopii Filmowych. Wacław Fabijanowski zmarł nagle w dniu 19 marca 1966 w Łodzi i spoczął na tamtejszym Starym Cmentarzu przy ulicy Ogrodowej. Jego grób zlikwidowano w 2016 i zajęto do nowego pochówku.
Rodzina W 1928 zawarł we Włocławku związek małżeński z Balbiną Matyldą Godlewską, z którą miał córkę Marię Bronisławę (urodzoną w Toruniu dnia 20 lutego 1933).