Kiedy książę i księżna Edynburga przybyli na Maltę po raz pierwszy, zatrzymali się w San Anton Palace, goszczeni przez Geralda Stricklanda i jego żonę. Księżniczka Elżbieta (późniejsza królowa Elżbieta II) i jej ówczesny narzeczony Philip Mountbatten (późniejszy książę Filip), po raz pierwszy zatrzymali się w Villa Guardamangia w roku 1946. Para powracała tam kilkakrotnie, aż do roku 1952, w czasie kiedy Filip stacjonował na Malcie jako oficer Royal Navy a Elżbieta pracowała w Soildiers, Sailors, Airmen Families Association (SSAFA) w Auberge de Castille. W końcu hrabia Mountbatten przekazał willę młodej parze, gdzie przebywała nieprzerwanie od roku 1949 do 1951. Sugerowano, że ich drugie dziecko, księżniczka Anna, została poczęta w willi. Królowa, która nazywała willę po prostu „Guardamangia”, opisywała swój pobyt na Malcie jako jeden z najlepszych okresów w życiu oraz że był to jedyny czas kiedy mogła żyć „normalnie”.
Królowa Elżbieta II odwiedziła Villa Guardamangia podczas swojej wizyty państwowej na Malcie w roku 1992;