Działalność naukowa Schrader zajmował się systematyką roślin i grzybów, w tym porostów, opisywał florę Niemiec (Spicilegium Florae germanicae, Flora germanica) a także sporządzał opisy pojedynczych gatunków (np. Nova genera plantarum, Abermalige Revision der Gattung Usnea, 1799; Commentatio super Veronicis spicatis Linnaei, 1803; Reliquiae Schraderianae, 1838). Badał rośliny zarodnikowe i wydał jedne z pierwszych zbiorów tych roślin przeznaczone do sprzedaży (Systematische Sammlung cryptogamischer Gewächse).
Publikacje Lista publikacji podana za Allgemeine Deutsche Biographie (ADB): 1794 – Spicilegium Florae germanicae 1795–1798 – Sertum Hannoveranum, seu plantae rariores, quae in hortis regiis Hannoverae vicinis coluntur 1797 – Nova genera plantarum 1799 – Abermalige Revision der Gattung Usnea 1803 – Commentatio super Veronicis spicatis Linnaei 1806 – Flora germanica 1809 – Hortus Gottingensis, sive plantae novae et rariores horti regii botanici Gottingensis 1809 – Genera nonnulla plantarum emendata et observationibus illustrata 1810 – De Halophytis Pallassii, respectu imprimis ad Salsolam et Suaedam habito commentatio 1813–1823 – Monograpbia generis Verbasci 1820 – De Asperifoliis Linnaei commentatio 1827 – Blumenbachia, novum e Loasearum familia genus, adjectis observationibus super nonnullis aliis