Nuncjatura Apostolska w Bawarii – misja dyplomatyczna Stolicy Apostolskiej w Elektoracie Bawarii (do 1806), Królestwie Bawarii (1806 - 1918) i Wolnym Kraju Bawaria (1918 - 1934). Siedziba nuncjusza apostolskiego mieściła się w Monachium.
Historia Od 1584 lub 1585 istniała Nuncjatura Apostolska w Kolonii. 7 czerwca 1784, za pontyfikatu Piusa VI, nuncjusz apostolski został ostatecznie akredytowany w Monachium. W 1805 zmieniono nazwę z Nuncjatura Apostolska w Kolonii na Nuncjatura Apostolska w Bawarii. Do 1871 Bawaria była niepodległym państwem, a po włączeniu w skład Cesarstwa Niemieckiego do 1918 zachowała możliwość prowadzenia własnej polityki zagranicznej.
Nuncjatura Apostolska w Bawarii nie została zlikwidowana po tym jak w 1920 powstała Nuncjatura Apostolska w Niemczech (przy rządzie centralnym w Berlinie). Do 1925 nuncjusz apostolski w Niemczech rezydował w Monachium zarządzając obiema nuncjaturami. 24 stycznia 1925 Bawaria ratyfikowała konkordat. Od tego roku w Bawarii był osobny nuncjusz apostolski. Nuncjatura Apostolska w Bawarii została zniesiona w 1934.
Dwóch nuncjuszy apostolskich w Kolonii/Bawarii zostało później papieżami.