Najważniejsza część zbiorów Archiwum Wschodniego dotyczyła historii Kresów Wschodnich, losów obywateli polskich w ZSRR i pod okupacją sowiecką oraz przesiedleń po II wojnie światowej.

Oprócz pozyskiwania źródeł archiwalnych Archiwum Wschodnie prowadziło również inną działalność. Zorganizowało kilka konkursów pamiętnikarskich, m.in.:

„Wschodnie piętno najnowszej historii Polski”, 1991 rok, współorganizatorzy: Polskie Towarzystwo Historyczne, Związek Sybiraków, Światowy Związek Żołnierzy AK;

„Kresy Wschodnie pod okupacjami 1939–45”, 1993 rok, współorganizator: Samodzielna Pracownia Dziejów Ziem Wschodnich II RP Instytutu Studiów Politycznych PAN.

W kwietniu 1992 został zorganizowany przez środowisko Archiwum Wschodniego i „Karty” „Tydzień Sumienia w Polsce”. W czerwcu 1993 odbył się „Tydzień Sumienia w Londynie”, którego współorganizatorem był komitet Archiwum Wschodniego działający w Londynie.

Działalność oddziałów terenowych Archiwum Wschodniego Oddział Archiwum Wschodniego we Wrocławiu Oddział Archiwum Wschodniego we Wrocławiu powstał w grudniu 1987 roku.