Struktura organizacyjna W skład ministerstwa wchodzi Gabinet Polityczny Ministra oraz następujące jednostki organizacyjne: Departament Analiz Gospodarczych Departament Bezpieczeństwa i Zarządzania Kryzysowego Departament Budżetu Gospodarki Departament Doskonalenia Regulacji Gospodarczych Departament Gospodarki Elektronicznej Departament Gospodarki Niskoemisyjnej Departament Handlu i Współpracy Międzynarodowej Departament Innowacji Departament Jednostek Nadzorowanych i Podległych Departament Komunikacji Departament Kontroli Departament Małych i Średnich Przedsiębiorstw Departament Obrotu Towarami Wrażliwymi i Bezpieczeństwa Technicznego Departament Prawny Departament Rozwoju Inwestycji Departament Spraw Europejskich Departament Zobowiązań i Analiz Biuro Administracyjne Biuro Dyrektora Generalnego Biuro Ministra.
Organy podległe ministrowi lub przez niego nadzorowane: Prezes Głównego Urzędu Miar Prezes Urzędu Zamówień Publicznych Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej
Jednostki organizacyjne podległe ministrowi: Polska Agencja Rozwoju Przedsiębiorczości Urząd Dozoru Technicznego wydziały/zespoły w stałych przedstawicielstwach Rzeczypospolitej Polskiej przy organizacjach międzynarodowych za granicą