Monitoring Rzadkich Dzięciołów (MRD) – koordynowany przez Ogólnopolskie Towarzystwo Ochrony Ptaków. W ramach programu prowadzona jest obserwacja 2 gatunków dzięcioła, tj.: dzięcioł trójpalczasty Picoides tridactylus dzięcioł białogrzbiety Dendrocopos leucotos W ramach programu wyznaczany jest wskaźnik liczebności gatunku oraz wskaźnik rozpowszechnienia się gatunku.
Monitoring Gatunków Rzadkich 1 (rybołów, orzeł przedni, orlik grubodzioby) – koordynowany przez Komitet Ochrony Orłów, a w jego ramach prowadzona jest obserwacja 3 gatunków ptaków, tj.: rybołów Pandion haliaeetus orzeł przedni Aquila chrysaetos orlik grubodzioby Aquila clanga W ramach programu prowadzona jest ewidencja krajowej populacji gatunku oraz jego rozmieszczenia.
Monitoring Gatunków Rzadkich 2 (łabędź krzykliwy, podgorzałka, biegus zmienny, mewa czarnogłowa), koordynowany przez Stację Ornitologiczną MIZ PAN. W ramach programu realizowana jest ewidencja krajowej populacji gatunku i jego rozmieszczenia. Program obejmuje monitoringiem 4 gatunki ptaków, tj.: łabędź krzykliwy Cygnus cygnus podgorzałka Aythya nyroca biegus zmienny Calidris alpina schinzii mewa czarnogłowa Larus melanocephalus Monitoring Gatunków Rzadkich 3 (kraska, dubelt, wodniczka, ślepowron), koordynowany przez Ogólnopolskie Towarzystwo Ochrony Ptaków.