W kolejnym sezonie obydwa zespoły kontynuowały działalność,zaprezentowały m.in. dobrze przyjętego Ajschylosa Prometeusza polskiego zespołu w reżyserii Kocura. Nieprozumienia pomiędzy Cynkutisem a Kocurem doprowadziły jednak do odejścia z teatru tego drugiego, a wraz z nim części zespołu. W styczniu 1987 roku w wypadku samochodowym pod Wrocławiem zginął Cynkutis. Pomimo niesprzyjających okoliczności Drugie Studio Wrocławskie kontynuowało działalność teatralną. W sezonie 1987/1988 do Drugiego Studia powrócił Mirosław Kocur, obejmując kierownictwo artystyczne.
W sierpniu 1989 roku podjęto decyzję o likwidacji Drugiego Studia Wrocławskiego jako główną przyczynę podając niski poziom artystyczny teatruR. Różycki Koniec Drugiego Studia Wrocławskiego, „Słowo Polskie” 1989, z 5 lipca, s. 3.. Ostatnią realizacją była reinscenizacja Eliasza Martina Bubera (pierwotnie wystawionego w reżyserii Mirosława Kocura w 1988 roku)R. Różycki, Eliasz, „Słowo Powszechne” 1989 nr 167, s. 4..