W październiku 2011 r. Departament Sprawiedliwości i nowojorski prokurator generalny złożyli pozwy cywilne przeciwko Bank of New York oskarżając go o manipulacje kursami walut przy transakcjach funduszy emerytalnych. Rzekomo do sprzedaży waluty bank korzystał z najniższych kursów na dany dzień, a do zakupu – najwyższe stawki, uwzględniając różnicę jako zysk firmy. Proceder miał trwać ponad dekadę i wygenerować 2 mld USD zysku. Przez długi czas bank bronił się, zaprzeczając oskarżeniom o oszustwo. W marcu 2015 r. spółka przyznała się do faktów dotyczących wprowadzenia w błąd w zakresie wyceny i realizacji kursów walut. Oprócz odejścia kluczowych menedżerów spółka musiała wypłacić 714 mln USD kosztem zadośćuczynienia.
Od kryzysu finansowego kapitał spółki systematycznie wzrastał, przez co w na odporność na negatywne scenariusze ekonomiczne BNY Mellon uzyskał najlepszy wynik spośród badanych instytucji. W 2014 r. w takim samym teście bank również znalazł się w czołówce.
W 2013 r. spółka rozpoczęła kampanię marketingową zawierającą nowe logo, która miała zwiększyć rozpoznawalność marki oraz rozpoczęła budowę nowego systemu informatycznego o nazwie .
W maju 2014 r. sprzedano budynek głównej siedziby spółki przy Wall Street.