Zdaniem autora, mniszka łuskolica nie pasowała do ówcześnie znanych rodzajów, jak Uroloncha (w ujęciu Sharpe’a; rodzaj obecnie niewyróżniany), Lepidopygia (obecnie Lemuresthes) i Spermestes. Nie wyróżnia się podgatunków.

Nazewnictwo W opublikowanym w 1999 Polskim nazewnictwie ptaków świata gatunek ten występował jako srebrnodziobek szarogłowy (co odpowiada anglojęzycznej nazwie Grey-headed Silverbill), na obecnej Kompletnej liście ptaków świata jest to już jednak mniszka łuskolica. Epitet gatunkowy griseicapilla oznacza z łaciny „o szarej czapce” (griseus – „szary”, capillus – „włosy na głowie”). Starszy, nieuznawany już epitet caniceps oznacza „szarogłowy” (canus – „szary”, -ceps od caput – „głowa”). Odontospiza natomiast oznacza z greki „uzębionego małego ptaka” (odous – „ząb”, spiza – „mały ptak wróblowy”).