Kapitalny remont budynku przeprowadzono w latach 1989–1992. Dobudowany został budynek administracyjny na podwórku, w wyniku czego zostało zwiększone miejsce na eksponaty, a warunki pracy się polepszyły. Parę lat później, po zakończeniu remontu, muzeum nadano nową, obecną nazwę. Dzięki kolejnemu gruntownemu remontowi, trwającemu od czerwca do listopada 2006 roku, poprawiły się warunki magazynowania muzealiów (dzięki specjalistycznym regałom oraz monitoringowi wilgotności i temperatury). Zadaszony został dziedziniec, na którym odbywają się imprezy, koncerty i spotkania.
Muzeum działa w zakresie edukacji, organizując warsztaty, zajęcia oraz lekcje dla dzieci i młodzieży. Cieszą się dużym zainteresowaniem. Tematy zajęć często dotyczą wystaw stałych lub czasowych.
Wedle stanu na 2022 rok zbiory muzeum liczą ponad 16 tys. muzealiów i ponad 10 tys. książek w bibliotece muzealnej.
Wystawy stałe „Ostrołęka i Kurpie. Między wątkiem historii a osnową życia” „Ostrołęka. 6 x Narew” „Wycinanka kurpiowska” „Twórczość żołnierzy powstania listopadowego na Wielkiej Emigracji” „Stanisław Skolimowski. Nierzeczywiste” „Galeria sztuki polskiej pierwszej połowy XX wieku”.