Przemysł rybny nadal znajduje się w fazie przejściowej pomimo znacznych zdolności rozwojowych i przetwórczych.
Rozległa uprawa ryb morskich była praktykowana w kraju w latach 50. XX wieku. Przemysł rybny jest sektorem hodowli przybrzeżnych i morskich hodowli morskich. Pstrągi rozwijają się głównie na południowym wschodzie, południowym zachodzie i północy, podczas gdy karpie występują głównie w centrum i na północy. Hodowla ryb koncentruje się głównie na gatunkach pstrąga tęczowego, dorady, karpia, tołpygi pstrej i amura.
Małże są szeroko rozpowszechnione na południu kraju, a szczególnie uprawiane w jeziorze obok Butrint, w pobliżu Morza Jońskiego. W 1980 wybudowano prawie 80 urządzeń do hodowli małży o średniej produkcji około 2000 ton rocznie, podczas gdy w 1989 wzrosła ona do 5000 ton rocznie. Po zakończeniu komunizmu i wybuchu epidemii cholery w 1990 produkcja gwałtownie spadła i została ponownie otwarta dopiero w 2000 roku.