Skënder Gjinushi (ur. 24 grudnia 1949 we Wlorze) – albański polityk i matematyk, przewodniczący prezydium parlamentu w latach 1997-2001, wicepremier i minister pracy i polityki społecznej w latach 2001-2002, minister edukacji w latach 1987-1991.
Kariera naukowa Syn oficera armii albańskiej Et'hema Gjinushiego. W latach 1968-1972 studiował matematykę na Uniwersytecie Tirańskim. Po ukończeniu studiów odbył specjalizację na Université Pierre et Marie Curie w Paryżu, gdzie w 1977 obronił pracę doktorską. Do 1987 wykładał na wydziale nauk o ziemi Uniwersytetu Tirańskiego. W 1986 uzyskał tytuł profesora. Zajmował się analizą funkcjonalną, tej tematyce poświęcił dwie książki i kilkanaście artykułów naukowych. Od 1989 członek Albańskiej Akademii Nauk, w 2019 objął funkcję jej prezesa. Za jego kandydaturą głosowało 35 członków Akademii, 6 było przeciwnych. W październiku 2023 został ponownie wybrany na to stanowisko.