Głównym inicjatorem utworzenia PTN był prof. Franciszek Kokot, który działał w międzynarodowych towarzystwach naukowych, m.in. w Europejskim Towarzystwie Dializoterapii i Transplantologii (). Ostatnia konferencja Sekcji Nefrologicznej TIP stała się Kongresem Założycielskim PTN. Podczas Kongresu ustanowiono Statut oraz wybrano pierwszy Zarząd Towarzystwa. Pierwszym Prezesem PTN został prof. Tadeusz Orłowski .
Cele statutowe Towarzystwo reprezentuje środowisko nefrologów; m.in. propaguje zdobycze nauki w dziedzinie nefrologii, dializoterapii i transplantacji nerek, a także współorganizuje ochronę zdrowia. Celem PTN jest też inspirowanie członków Towarzystwa do stałego podnoszenia kwalifikacji zawodowych, a także inicjowanie i wspieranie badań naukowych w dziedzinie nefrologii, dializoterapii i transplantacji nerek oraz krajowej i międzynarodowej wymiany naukowej. PTN zajmuje się również upowszechnianiem wiedzy o postępach nefrologii, dializoterapii i transplantacji nerek wśród lekarzy i pracowników ochrony zdrowia innych specjalności.