Historia Widyń powstał na miejscu dawnej celtyckiej wioski Dounonia. Rzymianie zbudowali tam miasto o nazwie Bononia przez Bułgarów nazwane Bdin lub Widin. Twierdza Baba Wida została zbudowana na fundamentach dawnej twierdzy Bononia prawdopodobnie pod koniec X wieku. Potem była wielokrotnie przebudowywana i rozbudowywana aż do XIV wieku, gdy stała się kwaterą główną i siedzibą lokalnych władców. Głównym zadaniem zamku miała być ochrona przebiegających tamtędy ważnych szlaków handlowych. Na przestrzeni wieków twierdza była wielokrotnie niszczona, odbudowywana i przebudowywana i wielokrotnie przechodziła z rąk do rąk. Władali nią kolejno Bułgarzy, Bizantyjczycy, Turcy i Habsburgowie. Okres rozkwitu Widynia nastąpił w XIV wieku, kiedy to miasto stało się stolicą tzw. carstwa widyńskiego, którym władał Ivan Stracimir. Jeszcze w tym samym wieku miasto zostało podbite i zajęte przez Turków. Obecny kształt nadano twierdzy na przełomie XVII i XVIII wieku, kiedy znajdowała się ona pod panowaniem Imperium Osmańskiego. W 1878 roku zakazano do niej wstępu, ponieważ była używana do celów wojskowych. Była wykorzystywana do końca XIX wieku, gdy mieściło się w niej więzienie i skład amunicji.