Wielki Mistrz 12 stycznia 1582 roku, po śmierci Jeana de la Cassiere, wybrany zostaje 52. Wielkim Mistrzem Rycerskiego Zakonu św. Jana z Jerozolimy, z Rodos i z Malty. Jakkolwiek odwieczny wróg Zakonu – Imperium Osmańskie, straciło już swoją moc, wciąż atakuje. W roku 1584, w odpowiedzi na uprowadzenie przez cztery tureckie galery 70 mieszkańców Gozo, Wielki Mistrz zarządza budowę fortu na Comino. Aby zebrać fundusze, za zgodą mieszkańców Gozo, opodatkowuje artykuły żywnościowe na tej wyspie.
thumb|left|Verdala Palace Plany ulepszenia fortyfikacji niestety nie pomogły w polepszeniu trudnych warunków socjalnych na wyspie. W roku 1591 wzrost populacji i niedobór żywności doprowadziły do głodu, a rok po tym wyspa została spustoszona przez zarazę. Verdalle kontynuował arogancję swych poprzedników, odmawiając społeczeństwu maltańskiemu jego praw i przywilejów. Jego despotyzm był jednak oświecony; ustanowił on przepisy dla bezpieczeństwa publicznego, chronił rolnictwo, i pokazał swoje zainteresowanie edukacją, lokując w roku 1592 w Valletcie Collegium Melitense, prowadzone przez, sprowadzonych tego samego roku na Maltę, Jezuitów.