Класификацията на бактериите по-долу включва всички семейства на царство Бактерии (Bacteria).
Класификация Царство Бактерии
Тип Acidobacteria Cavalier-Smith, 2002 Клас Acidobacteria Cavalier-Smith, 2002 Разред Acidobacteriales Cavalier-Smith, 2002 Семейство Acidobacteriaceae Клас Solibacteres Разред Solibacterales Семейство Solibacteraceae Тип Актинобактерии (Actinobacteria) Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey, 1997 Клас Актинобактерии (Actinobacteria) Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey, 1997 Подклас Acidimicrobidae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey, 1997 Разред Acidimicrobiales Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey, 1997 Семейство Acidimicrobiaceae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey, 1997 Подклас Actinobacteridae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey, 1997 Разред Актиномицети (Actinomycetales) Buchanan, 1917 Подразред Actinomycineae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey, 1997 Семейство Actinomycetaceae Подразред Corynebacterineae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey, 1997 Семейство Corynebacteriaceae Семейство Dietziaceae Семейство Gordoniaceae Семейство Mycobacteriaceae Семейство Nocardiaceae Семейство Segniliparaceae Семейство Tsukamurellaceae Семейство Williamsiaceae Подразред Frankineae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey, 1997 Семейство Acidothermaceae Семейство Frankiaceae Семейство Geodermatophilaceae Семейство Kineosporiaceae Семейство Nakamurellaceae Семейство Sporichthyaceae Подразред Glycomycineae Rainey, Ward-Rainey & Stackebrandt, 1997 Семейство Glycomycetaceae Подразред Micrococcineae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey, 1997 Семейство Beutenbergiaceae Семейство Bogoriellaceae Семейство Brevibacteriaceae Семейство Cellulomonadaceae Семейство Dermabacteraceae Семейство Dermacoccaceae Семейство Dermatophilaceae Семейство Intrasporangiaceae Семейство Jonesiaceae Семейство Microbacteriaceae Семейство Micrococcaceae Семейство Promicromonosporaceae Семейство Rarobacteraceae Семейство Sanguibacteraceae Семейство Yaniellaceae Подразред Micromonosporineae Семейство Micromonosporaceae Подразред Propionibacterineae Семейство Nocardioidaceae Семейство Propionibacteriaceae Подразред Pseudonocardineae Семейство Actinosynnemataceae Семейство Pseudonocardiaceae Подразред Streptomycineae Семейство Streptomycetaceae Подразред Streptosporangineae Семейство Nocardiopsaceae Семейство Streptosporangiaceae Семейство Thermomonosporaceae Разред Bifidobacteriales Семейство Bifidobacteriaceae Семейство Bifidobacteriales Подклас Coriobacteridae Разред Coriobacteriales Подразред Coriobacterineae Семейство Coriobacteriaceae Подклас Rubrobacteridae Разред Rubrobacterales Подразред Rubrobacterineae Семейство Rubrobacteraceae Тип Aquificae Reysenbach, 2002 Клас Aquificae Reysenbach, 2002 Разред Aquificales Семейство Aquificaceae Семейство Desulfurobacteriaceae Семейство Hydrogenothermaceae Тип Bacteroidetes (Garrity & Holt, 2001) Клас Bacteroidetes Разред Bacteroidales Семейство Bacteroidaceae Семейство Porphyromonadaceae Семейство Prevotellaceae Семейство Rikenellaceae Клас Flavobacteria Разред Flavobacteriales Семейство Blattabacteriaceae Семейство Flavobacteriaceae Семейство Myroidaceae Клас Sphingobacteria Разред Sphingobacteriales Семейство Crenotrichaceae Семейство Flammeovirgaceae Семейство Flexibacteraceae Семейство Saprospiraceae Семейство Sphingobacteriaceae Тип Хламидии (Chlamydiae) Cavalier-Smith, 2002 Клас Chlamydiae Cavalier-Smith, 2002 Разред Chlamydiales Storz & Page, 1971 Семейство Chlamydiaceae Семейство Parachlamydiaceae Семейство Rhabdochlamydiaceae Семейство Simkaniaceae Семейство Waddliaceae Тип Chlorobi Garrity & Holt, 2001 Клас Chlorobia Разред Chlorobiales Семейство Chlorobiaceae Тип Chloroflexi (Garrity & Holt) Hugenholtz & Stackebrandt, 2004 Клас Anaerolineae Yamada, 2006 Разред Anaerolinaeles Yamada, 2006 Семейство Anaerolineaceae Yamada, 2006 Клас Chloroflexi Разред Chloroflexales Семейство Chloroflexaceae Разред Herpetosiphonales Семейство Herpetosiphonaceae Клас Thermomicrobia Разред Sphaerobacterales Подразред Sphaerobacterineae Семейство Sphaerobacteraceae Разред Thermomicrobiales Семейство Thermomicrobiaceae Тип Chrysiogenetes Garrity & Holt, 2002 Клас Chrysiogenetes Разред Chrysiogenales Garrity & Holt, 2002 Семейство Chrysiogenaceae Тип Цианобактерии (Cyanobacteria) Stanier & Cavalier-Smith, 2002 Клас Chroobacteria Разред Chroococcales Семейство Chamaesiphonaceae Семейство Chroococcaceae Семейство Dermocarpellaceae Семейство Entophysalidaceae Семейство Gloeobacteraceae Семейство Hydrococcaceae Семейство Hyellaceae Семейство Merismopediaceae Семейство Microcystaceae Семейство Synechococcaceae Семейство Xenococcaceae Разред Oscillatoriales Семейство Ammatoideaceae Семейство Borziaceae Семейство Gomontiellaceae Семейство Oscillatoriaceae Семейство Phormidiaceae Семейство Pseudanabaenaceae Семейство Schizotrichaceae Клас Hormogoneae Разред Nostocales Cavalier-Smith, 2002 Семейство Microchaetaceae Семейство Nostocaceae Семейство Rivulariaceae Семейство Scytonemataceae Разред Stigonematales Семейство Borzinemataceae Семейство Capsosiraceae Семейство Chlorogloeopsaceae Семейство Fischerellaceae Семейство Loriellaceae Семейство Mastigocladaceae Семейство Nostochopsaceae Семейство Stigonemataceae Тип Deferribacteres Huber & Stetter, 2002 Клас Deferribacteres Разред Deferribacterales Семейство Deferribacteraceae Тип Deinococcus-Thermus Garrity & Holt, 2002 Клас Deinococci Разред Deinococcales Семейство Deinococcaceae Разред Thermales Семейство Thermaceae Тип Dictyoglomi Saiki, 1985 Клас Dictyoglomi Разред Dictyoglomales Семейство Dictyoglomaceae Тип Fibrobacteres Garrity & Holt, 2001 Клас Fibrobacteres Разред Fibrobacterales Семейство Fibrobacteraceae Тип Фирмикути (Firmicutes) Gibbons & Murray, 1978 Клас Бацили (Bacilli) Разред Бацилоподобни (Bacillales) Семейство Alicyclobacillaceae Семейство Бацилови (Bacillaceae) Семейство Caryophanaceae Семейство Listeriaceae Семейство Paenibacillaceae Семейство Planococcaceae Семейство Sporolactobacillaceae Семейство Staphylococcaceae Семейство Thermoactinomycetaceae Семейство Turicibacteraceae Разред Лактобацилоподобни (Lactobacillales) Семейство Aerococcaceae Семейство Carnobacteriaceae Семейство Enterococcaceae Семейство Лактобацилови (Lactobacillaceae) Семейство Leuconostocaceae Семейство Oscillospiraceae Семейство Streptococcaceae Клас Clostridia Разред Clostridiales Семейство Acidaminococcaceae Семейство Clostridiaceae Семейство Eubacteriaceae Семейство Heliobacteriaceae Семейство Lachnospiraceae Семейство Peptococcaceae Семейство Peptostreptococcaceae Семейство Syntrophomonadaceae Разред Halanaerobiales Семейство Halanaerobiaceae Семейство Halobacteroidaceae Разред Thermoanaerobacteriales Семейство Thermoanaerobacteraceae Семейство Thermodesulfobiaceae Клас Mollicutes Разред Acholeplasmatales Семейство Acholeplasmataceae Разред Anaeroplasmatales Семейство Anaeroplasmataceae Разред Entomoplasmatales Семейство Entomoplasmataceae Семейство Spiroplasmataceae Разред Mycoplasmatales Семейство Mycoplasmataceae Тип Фузобактерии (Fusobacteria) C.H. Steeves, 2009 Клас Fusobacteria Разред Fusobacterales Семейство Fusobacteriaceae Тип Gemmatimonadetes Zhang, Sekiguchi, Hanada, Hugenholtz, Kim, Kamagata & Nakamura, 2003 Клас Gemmatimonadetes Zhang, Sekiguchi, Hanada, Hugenholtz, Kim, Kamagata & Nakamura, 2003 Разред Gemmatimonadales Семейство Gemmatimonadaceae Тип Lentisphaerae Cho, 2004 Разред Lentisphaerales Cho, 2004 Семейство Lentisphaeraceae Разред Victivallales Cho, 2004 Семейство Victivallaceae Тип Nitrospirae Watson, 1986 Клас Nitrospira Разред Nitrospirales Семейство Nitrospiraceae Тип Planctomycetes Schlesner et Stackebrandt, 1987 Клас Planctomycetacia Разред Planctomycetales Семейство Planctomycetaceae Тип Протеобактерии (Proteobacteria) Stackebrandt, 1988 Клас Алфа протеобактерии (Alpha proteobacteria) Garrity, 2005 Разред Caulobacterales Henrici & Johnson, 1935 Семейство Caulobacteraceae Разред Kopriimonadales Семейство Kopriimonadaceae Разред Kordiimonadales Kwon, 2005 Семейство Kordiimonadaceae Разред Parvularculales Семейство Parvularculaceae Разред Rhizobiales Kuykendall, 2006 Семейство Aurantimonadaceae Семейство Bartonellaceae Семейство Beijerinckiaceae Семейство Bradyrhizobiaceae Семейство Brucellaceae Семейство Hyphomicrobiaceae Семейство Methylobacteriaceae Семейство Methylocystaceae Семейство Phyllobacteriaceae Семейство Rhizobiaceae Семейство Rhodobiaceae Разред Rhodobacterales Garrity, 2006 Семейство Rhodobacteraceae Разред Rhodospirillales Семейство Acetobacteraceae Семейство Rhodospirillaceae Разред Rickettsiales Gieszczykiewicz, 1939 Семейство Anaplasmataceae Семейство Holosporaceae Семейство Rickettsiaceae Разред Sphingomonadales Семейство Erythrobacteraceae Семейство Sphingomonadaceae Клас Бета протеобактерии (Beta proteobacteria) Garrity, 2005 Разред Burkholderiales Семейство Alcaligenaceae Семейство Burkholderiaceae Семейство Comamonadaceae Семейство Oxalobacteraceae Разред Hydrogenophilales Семейство Hydrogenophilaceae Разред Methylophilales Семейство Methylophilaceae Разред Neisseriales Семейство Neisseriaceae Разред Nitrosomonadales Семейство Gallionellaceae Семейство Nitrosomonadaceae Семейство Спирилови (Spirillaceae) Разред Procabacteriales Семейство Procabacteriaceae Разред Rhodocyclales Семейство Rhodocyclaceae Клас Гама протеобактерии (Gamma proteobacteria) Garrity, 2005 Разред Acidithiobacillales Garrity, 2005 Семейство Acidithiobacillaceae Семейство Thermithiobacillaceae Разред Aeromonadales Семейство Aeromonadaceae Семейство Succinivibrionaceae Разред Alteromonadales Семейство Alteromonadaceae Семейство Colwelliaceae Семейство Ferrimonadaceae Семейство Idiomarinaceae Семейство Moritellaceae Семейство Pseudoalteromonadaceae Семейство Psychromonadaceae Семейство Shewanellaceae Разред Cardiobacteriales Семейство Кардиобактериеви (Cardiobacteriaceae) Разред Chromatiales Семейство Chromatiaceae Семейство Ectothiorhodospiraceae Семейство Halothiobacillaceae Разред Enterobacteriales Семейство Enterobacteriaceae Разред Legionellales Garrity, 2005 Семейство Коксиелови (Coxiellaceae) Семейство Legionellaceae Разред Methylococcales Семейство Methylococcaceae Разред Oceanospirillales Семейство Alcanivoracaceae Семейство Hahellaceae Семейство Халомонадови (Halomonadaceae) Семейство Oceanospirillaceae Семейство Oleiphilaceae Семейство Saccharospirillaceae Разред Pasteurellales Семейство Pasteurellaceae Разред Pseudomonadales Семейство Moraxellaceae Семейство Pseudomonadaceae Разред Thiotrichales Семейство Francisellaceae Семейство Piscirickettsiaceae Семейство Thiomicrospiraceae Семейство Thiotrichaceae Разред Vibrionales Семейство Vibrionaceae Разред Xanthomonadales Семейство Xanthomonadaceae Клас Делта протеобактерии (Delta proteobacteria) Kuever, 2006 Разред Bdellovibrionales Семейство Bacteriovoracaceae Семейство Bdellovibrionaceae Разред Desulfobacterales Семейство Desulfoarculaceae Семейство Desulfobacteraceae Семейство Desulfobulbaceae Разред Desulfovibrionales Семейство Desulfohalobiaceae Семейство Desulfomicrobiaceae Семейство Desulfonatronumaceae Семейство Desulfovibrionaceae Разред Desulfurellales Семейство Desulfurellaceae Разред Desulfuromonadales Семейство Desulfuromonadaceae Семейство Geobacteraceae Семейство Pelobacteraceae Разред Myxococcales Подразред Cystobacterineae Семейство Cystobacteraceae Семейство Myxococcaceae Подразред Nannocystineae Семейство Haliangiaceae Семейство Nannocystaceae Подразред Sorangineae Семейство Polyangiaceae Разред Syntrophobacterales Семейство Syntrophaceae Семейство Syntrophobacteraceae Клас Епсилон протеобактерии (Epsilon proteobacteria) Garrity, 2006