В Република Северна Македония има над 360 реки с дължена над 10 km. Те се отнасят към 5 главни водосборни басейна: Егейско море, Адриатическо море, Черно море и един безотточен водосборен басейн на Преспанското. От своя страна водосборния басейн на Егейско море се поделя на два основни водосборни басейна – този на река Вардар, обхващащ над 3/4 от територията на страната и този на река Струма, простиращ се в югоизточната част на Северна Македония. Към водосборния басейн на Адриатическо море пренадлежи река Черни Дрин, лява съставяща на река Дрин, вливаща се в Адриатическо море на албанска територия. Към водосборния басейн на Черно море принадлежи най-горното течение на река Южна Морава, дясна съставяща на Велика Морава, която е десен приток на Дунав.
На базата на тези водосборни басейни е съставен списъкът с реките на Северна Македония. За по-големите реки е отразено какъв приток е (ляв → или десен ←), нейната дължина в km и площта на водосборния ѝ басейн в km². Реките, които са частично на територията на Северна Македония са обозначени със звездичка и ако има данни е показана и тяхната дължина (в скоби) на територията на Северна Македония. Звездичките пред имената на реките показват от кой парядък е раката: * - първи порядък; ** – втори порядък (приток на река от първи порядък); *** - трети порядък и т.н. Изброяването на притоците, притоците на техните притоци и т.н. става от извора към устието на съответната река.
Водосборен басейн на Егейско море Вардарски водосборен басейн Вардар* 388 (301)/25400 Лакавица Гьоновица Железна река → Маздрача 24,5/140 Равенска река Йеловинска река Палчишка река Боговинска река Каменянска река → Пена (Тетовска река) 29,7/184 → Бистрица (Теарска Бистрица) 18,8/48 Ракита (Вратничка река) Радуша (Яжиначка река) → Лепенец* 75/770 Вражанска река Банянска река Мирковичка река ← Треска 127/2068 Заяска река Темница Сушица → Мала река Беличка река (Белешница) Столарешка Оча Кобилина река Оча Слатинска река → Студенчица 16/53 Рабетинска река Бържданска река Лощица → Серава 21/67 Любанска река Побушка река Люботенска река ← Маркова река 30/184 Патишка река Дресница Булачанска река Жегровец ← Кадина река 34/184 Мала река ← Тополка 45/313 Отищинска река Горноврановска река ← Бабуна 65/612 Брезица Църнушка река Църничка река Войница → Пчиня 128/3140 → Бистрица (Пчинска Бистрица) ?/48 Петрошница → Крива река 75/1002 → Дурачка река 15/? Кратовска река Лучка река Радибушка река Киселичка река Брадишки дол Гораница Сакарбашки дол ← Кумановска река (Кумановка) 44/460 ← Липковска река 17,5/300 Конярска река (Табановска река, Баника) Серава (Старонагоричанска Серава) Лука Клисура Козедолска река Беловлайковска река Алгунска река (Вучковска река) ← Брегалница 225/4307 Ратевска река Лютачка река Рамна река Желевица Кадънка Спряжева река Ракитина река ← Каменица (Каменичка река) 23/115 Дулица (Мековска река) → Осойница 32/? Виничка река Пеклянска река Блатешница Градечка река → Зърновска река 21/70 ← Оризарска река 30/133 Кочанска река 34/? Търканска река Белски дол Голема река Мала река ← Злетовщица (Злетовица) 56/460 Банска река Киселица Белощица Щалковица Зеленградска река Древенска река Ратавица Кислица Аргуличка река Раданска река Отиня → Крива Лъкавица 42/417 Маденска река ← Светиниколска река 35/659 Мавровица Горобинска река Караташ ← Църна 207/5890* Боишка река → Блато (Блатище) 44/? Стара река ← Конярска река 15/? Голема река Прилепска река Щавичка река Новолаговска река Боротинска река Житошка река Ягула Крушевска река Строшка река (Рибник) Долгаечка река Сажлица Обедничица Журешница Селечка река ← Шемница 46/? Чагорска река Стара река Лисолайска река Секиранска река Жаба Церска река ← Драгор 32/188 Стара река ← Сакулева* (Йелашка река, Йелешка река, Елешка река) 50/? ← Конарска река 30/180 ← Градешка река 26/116 ← Сатока 22/104 Лешница Маковска река Рапешка река → Раец 33/305 Свинярница Церешевица Крушевица (Подлеска река) Чичевска река Сиркова река Круевичка река Камен дол (Мързенска река) Фаришка река Шивечки дол (Шивец) Праведнишки дол Драгожелска река Бистра Сушица ← Блащица ?/184 Дунска река Бутурица Крушевичка река (Чанишка Крушевица) Бешишка река Полчишка река Белица (Бела река) Търновчица Конярска река Ракита Рибник Базик Лажечка река (Кишовска река) Мала река Велушка река Граешка река Суводол (Суводолска река, Реката, Гнеотинска река) Добрушева река Подмолска река Мъртвица Стара река Агларски дол Путуруска река Кобел Глабокова река Шелеверска река Тополчанска река ← Луда Мара (Ваташка река, Курячка река) 34/140 Маренска река Неготинска река ← Бошава 52/468 ← Дошница 39/193 Драчевица Бохулска река Бистра Аразлийска река Градешка река Петрушка река Стара река Калица → Анска река 22/166 Башибоска река Луда Мара Кованска река Зуица Богданска Луда Мара Чаушлийска река Габрошка река Серменинска река Конска река (Сува река, Цреша)
Водосборен басейн на Дойранското езеро (чрез река Гьолая се оттича в река Вардар) Николичка река Сува река Асанлийска река Сретенова река Църни поток (Ливадица) Раскръсница (Вая)
Струмски водосборен басейн Струма 415/17300 (извън територията на Северна Македония) ← Лебница* 50 (8)/318 Мала река Цървилска река Циронска река (Дворишка река, Цървилска река) ←Струмица* 114 (81)/1900 Байковица Василица Новоселка Водочница Търкайна → Турия 45/263 Иловица Балдовица Щучка река (Щука река) Язга Барличка река Радовишка река Ораовичка река Пладнище Плавия Возенска река Буковик Грабичка река Азмак Стара река Ломница Сува река
Водосборен басейн на Адриатическо море Дрински водосборен басейн Велестова река (влива се в Охридското езеро) Далян (Коселска река, Опейничка река, Крива река) 66/? (влива се в охридското езеро) ← Вапилница Радолищица (влива се в Охридското езеро) Дрин 148/1260 (извън територията на Северна Македония) Черни Дрин* 159 (56)/3504 ← Мислешева река ← Сътеска (Мороищенска) 31/396 → Голема река (Плакенска) 24/123 → Беличка река → Вевчанска река → Лабунищка река (Сушица, Лабунишка Сушица) (влива се в езе. Глобочица) ← Голема река → Ябланска река (Ябланишка река) → Модричка река ← Буринечка река (Селска река) (влива в Дебърското езеро) ← Долгашка река (Козаджик, Елевска река) (влива се в Дебърското езеро) ← Осолнишка река (влива се в Дебърското езеро) ← Брещанска река (Брестанска река) (влива се в Дебърското езеро) ← Радика (влива се в Дебърското езеро) 67/665 → Ацина река → Стрезимирска река → Мавровска река Леунова река (влива се в Мавровското езеро) ← Рибнишка река (Рибница) → Длабока река ← Жировничка река ← Требишка река → Мала река (Тресонечка река) 21/200 Ядовска река Росочка река Новачко речище Гарска река Осойска река Белешница ← Райчица (Речица, Раичка река) (влива се в Дебърското езеро) ← Таранешка река (Селокушка река, Хамска река)
Водосборен басейн на Черно море Дунавски водосборен басейн Дунав 2852/817 000 (извън територията на Северна Македония) ← Велика Морава 185/37 444 (извън територията на Северна Македония) ←Южна Морава (Биначка Морава, Голема река, Ключева река)* 295/15 469 Грънчарица Летница Прои и Салахит Слатинска река
Безотточен водосборен басейн Водосборен басейн на Преспанското езеро Брайчинска река Шара (Кранска, Ърватска) Маркова река Курбинска река Голема река Болнска река Отешевска река
Вижте също География на Северна Македония