Nogometna reprezentacija Estonije je u svojoj dosadašnjoj historiji nastupila šest puta u kvalifikacijama za Evropsko prvenstvo u kojim nije uspjela ostvariti plasman na Evropsko prvenstvo. Najbolji plasman u kvalifikacijama Estonija je ostvarila osvojivši drugo mjesto u kvalifikacijskoj grupi u kvalifikacijama za prvenstvo 2012. Međutim, u baražu je Irska bila uspješnija te se kvalificirala na prvenstvo.
Statistika
Kvalifikacije za Evropsko prvenstvo 1996.
Kvalifikacije za Evropsko prvenstvo 2000.
Kvalifikacije za Evropsko prvenstvo 2004.
Kvalifikacije za Evropsko prvenstvo 2008.
Kvalifikacije za Evropsko prvenstvo 2012.
Baraž
Kvalifikacije za Evropsko prvenstvo 2016.
Reference
Vanjski linkovi Estonija na zvaničnoj stranici UEFA-e
Rezultati u kv. za EP