Sistem APG III klasifikacije cvjetnica treća je verzija taksonomije biljaka, koja uglavnom počiva na molekulskofilogenetilkim analizama koje je razvila Grupa za filogeniju angiospermi (APG). Objavljen je 2009. godine, a supstituiran 2016. dodatnom revizijom, sistemom APG IV.

Uz publikaciju koja je izvijestila o novom sistemu, u istom su broju „Botaničkog časopisa lineovskog društva (Botanical Journal of the Linnean Society) bile dvije popratne publikacije. Prva, Chasey & Reveala, bila je formalna filogenetska klasifikacija svih kopnenih biljaka (embriofita), kompatibilna s klasifikacijom APG III. Kako je Grupa za filogeniju angiospermi izabrala da izbjegnu rangove iznad reda, ovaj rad je trebao da uklopi sistem u postojeću linaeovsku takonomsku hierarhiju za one koji preferiraju takvu klasifikaciju. Rezultat je bio da su sve biljke bile smještene u razred Equisetopsida koja je tada podijeljena na 16 podrazreda i mnoštvo nadredova. U drugom, Haston et al. objaviuli su linearni redoslijed porodica koje su slijedile sistem APG III (LAPG III).

Ovo je omogućilo numeriranu listu sa 413 porodica u APG III. Linearni niz je od posebne koristi za herbarijske kustose i one koji rade na florističkim radovima koji žele urediti svoje taksone prema APG III.Haston, E., Richardson, J.E., Stevens, P.F., Chase, M.W., Harris, D.J. (2009) The Linear Angiosperm Phylogeny Group (LAPG) III: a linear sequence of the families in APG III. Botanical Journal of the Linnean Society 161, 128–131.

Organizacija APG III sistem prepoznao je svih 45 redova prethodnog sistema, kao i 14 novih. Red Ceratophyllales pogrešno je označen kao novi, jer je prepoznat u oba prethodna APG sistema. NovopriznatI redovi bilI su: Amborellales, Nymphaeales, Chloranthales, Petrosaviales, Trochodendrales, Buxales, Vitales, Zygophyllales, Picramniales, Huerteales, Berberidopsidales, Escalloniales, Bruniales i Paracryphiales.

U APG III odustalo se od imenovanja alternativnih "nosećiih porodica", jer je njihovo uključivanje u prethodni sistem bilo nepopularno. APG III prepoznao je 413 porodice, 43 manje nego u prethodnom sistemu. Četrdeset četiri od 55 "noseće porodice" su prekinute (nepodržane), a 20 drugih porodica je također nepodržano.

Napuštene porodice sa sestinskim bile su: Illiciaceae, Alliaceae, Agapanthaceae, Agavaceae, Aphyllanthaceae, Hesperocallidaceae, Hyacinthaceae, Laxmanniaceae, Ruscaceae, Themidaceae, Asphodelaceae, Hemerocallidaceae, Kingdoniaceae, Fumariaceae, Pteridophyllaceae, Didymelaceae, Tetracentraceae, Pterostemonaceae, Hypseocharitaceae, Francoaceae, Memecylaceae, Lepuropetalaceae, Rhoipteleaceae, Medusagynaceae, Quiinaceae, Malesherbiaceae, Turneraceae, Bretschneideraceae, Diegodendraceae, Cochlospermaceae, Peganaceae, Tetradiclidaceae, Nyssaceae, Ternstroemiaceae, Pellicieraceae, Aucubaceae, Donatiaceae, Lobeliaceae, Desfontainiaceae, Diervillaceae, Dipsacaceae, Linnaeaceae, Morinaceae i Valerianaceae.

Ostale bez kontinuiteta bile su: Limnocharitaceae, Luzuriagaceae, Sparganiaceae, Ixerbaceae, Ledocarpaceae, Heteropyxidaceae, Psiloxylaceae, Oliniaceae, Rhynchocalycaceae, Parnassiaceae, Maesaceae, Myrsinaceae, Theophrastaceae, Eremosynaceae, Polyosmaceae, Tribelaceae, Sphenostemonaceae, Aralidiaceae, Mackinlayaceae, and Melanophyllaceae.

APG III sIstem prihvatio je 21 porodicu, kojih nije bilo u prethodnom sistemu, a nekoliko ih je promijenilo taksonomski položaj. Novoprepoznate porodice bile su: Cynomoriaceae, Haptanthaceae, Petermanniaceae, Schoepfiaceae, Limeaceae, Lophiocarpaceae, Montiaceae, Talinaceae, Anacampserotaceae, Centroplacaceae, Calophyllaceae, Guamatelaceae, Gerrardinaceae, Dipentodontaceae, Capparidaceae, Cleomaceae, Cytinaceae, Mitrastemonaceae, Metteniusaceae, Linderniaceae, and Thomandersiaceae.

Broj porodica koje nisu smještene u bilo koji red smanjen je sa 39 na 10. Apodanthaceae i Cynomoriaceae svrstane su među angiosperme, incertae sedis, odnosno ni u jednu grupu unutar angiospermi. Osam drugih porodica smješteno je u vrste incertae sedis u raznim grupama nadredova unutar angiospermi. Porodice koje nisu ni u kom redu bile su: Apodanthaceae, Cynomoriaceae, Dasypogonaceae, Sabiaceae, Dilleniaceae, Icacinaceae, Metteniusaceae, Oncothecaceae, Vahliaceae i Boraginaceae. Paragraf ispod prikazuje broj porodica u svakom redu i razmještaj onih koje nisu bile uključene ni u jedan red. Ti brojevi dobijeni su jednostavnim prebrojavanjem porodica u tekstu rada koji je uspostavio APG III.

Redovi: Amborellales (1), Nymphaeales (3), Austrobaileyales (3), Chloranthales(1), Canellales (2), Piperales (5), Magnoliales (6), Laurales (7), Acorales (1), Alismatales (13), Petrosaviales (1), Dioscoreales (3), Pandanales (5), Liliales (10),Asparagales (14), Arecales (1), Poales (16), Commelinales (5), Zingiberales (8),Ceratophyllales (1), Ranunculales (7), Proteales (3), Trochodendrales (1), Buxales (2), Gunnerales (2),Saxifragales (14), Vitales (1), (2), Celastrales (2), Oxalidales (7),Malpighiales (35), Fabales (4), Rosales (9), Fagales (7), Cucurbitales (7), Geraniales (3), Myrtales (9), Crossosomatales (7), Picramniales (1), Sapindales (9), Huerteales (3), Brassicales (17), Malvales (10), Berberidopsidales (2), Santalales (7), Caryophyllales (34), Cornales (6), Ericales (22), Garryales (2), Gentianales(5), Solanales (5), Lamiales (23), Aquifoliales (5), Asterales (11), Escalloniales (1), Bruniales (2), Apiales (7), Paracryphiales (1), Dipsacales (2).

NADREDNE GRUPE: Commelinida (1), Bazne eudikotiledone (1), Pentapetalae (1), Lamiide incertae sedis (3), Jezgarne lamiide (2), Angiosperme incertae sedis (2). Opseg porodice Icacinaceae ostaje posebno dvojben. Rod Apodytes i njegov bliski srodnik, Rhaphiostylis, kao i Emmotum, Cassinopsis i nekokicina drugih rodova privremeno su zadržani dok dalje studije ne mognu utvrditi pripadaju li tamo ispravno.

Tri vrste roda (Gumillea, Nicobariodendron i Petenaea) smještene su u angiosperme incertae sedis. "Gumillea" je bila zamienjena u APG II. Na listu su dodani rodovi Nicobariodendron i Petenaea. Potonji je kasnije smješten u vlastitu porodicu Petenaeaceae u redu Huerteales.Christenhusz, M. J. M., M. F. Fay, J. J. Clarkson, P. Gasson, J. Morales Can, J. B. Jimenez Barrios & M. W. Chase (2010). Petenaeaceae, a new angiosperm Porodica in Huerteales with a distant relationship to Gerrardina (Gerrardinaceae), Botanical Journal of the Linnean Society 164: 16-25. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1095-8339.2010.01074.x/abstractChristenhusz, M. J. M., M. W. Chase, & M.F.Fay (2011). Preface to "Linear sequence, classification, synonymy, and bibliography of vascular plants: Lycophytes, ferns, gymnosperms and angiosperms", Phytotaxa 19: 4–6. http://www.mapress.com/phytotaxa/content/2011/f/pt00019p006.pdf

U nastavku, klasifikacija je prikazana u dvije verzije. Kratka verzija ide na nivo redova i porodica koje nisu smještene u redove. Detaljna verzija prikazuje sve porodice. Redovi na istoj razini u klasifikaciji raspoređeni su po abecednom redu. Pritom redovi ne mogu sadržavati iste porodice kao u starijim verzijama APG sistema (APG sistem, sistem APG II).

Daljnji detalji o vezama mogu se vidjeti u filogenetskom stablu ispod.

Kratka verzija Kladus Angiosperme Red Amborellales Red Nymphaeales Red Austrobaileyales Red Chloranthales Kladus Magnoliide Red Canellales Red Laurales Red Magnoliales Red Piperales Kladus Monokotiledone Red Acorales Red Alismatales Red Asparagales Red Dioscoreales Red Liliales Red Pandanales Red Petrosaviales Kladus Commelinide Porodica Dasypogonaceae — neuključene u red Red Arecales Red Commelinales Red Poales Red Zingiberales Vjerovatno sestrinske za eudikotiledone Red Ceratophyllales Kladus Eudikotiledone Porodica Sabiaceae — neuključene u red Red Buxales Red Proteales Red Ranunculales Red Trochodendrales Kladus Jezgarne eudikotiledone Porodica Dilleniaceae — neuključene u red Red Gunnerales Red Saxifragales Kladus Roside Red Vitales Kladus Fabide (euroside I) Red Celastrales Red Cucurbitales Red Fabales Red Fagales Red Malpighiales Red Oxalidales Red Rosales Red Zygophyllales Kladus Malvide (euroside II) Red Brassicales Red Crossosomatales Red Geraniales Red Huerteales Red Malvales Red Myrtales Red Picramniales Red Sapindales (Vraćene u jezgarne eudikotiledone) Red Berberidopsidales Red Caryophyllales Red Santalales Kladus asterids Red Cornales Red Ericales Kladus lamiids (euasterids I) Porodica Boraginaceae — neuključene u red Porodica Vahliaceae — neuključene u red Porodica Icacinaceae — neuključene u red Porodica Metteniusaceae — neuključene u red Porodica Oncothecaceae — neuključene u red Red Garryales Red Gentianales Red Lamiales Red Solanales Kladus Campanulide (euasteride II) Red Apiales Red Aquifoliales Red Asterales Red Bruniales Red Dipsacales Red Escalloniales Red Paracryphiales

Detaljna verzija Oznake: * = new Porodica placement; † = Novoprepoznati red u APG sistemu; § = Novoopisana porodica u tekstu; $ = Porodice koje imaju širi opseg od opcija koje su dostupne u APG II i koje su ovdje prihvaćene; $$ = Porodice koje su u APG II bile u uglatim zagradama, ovdje su prihvačene u užem opsegu.

Angiosperme †Amborellales Melikyan, A.V.Bobrov & Zaytzeva Amborellaceae Pichon †Nymphaeales Salisb. ex Bercht. & J.Presl $$Cabombaceae Rich. ex A.Rich. *Hydatellaceae U.Hamann $$Nymphaeaceae Salisb. Austrobaileyales Takht. ex Reveal Austrobaileyaceae Croizat $Schisandraceae Blume (including Illiciaceae A.C.Sm.) Trimeniaceae L.S.Gibbs †Chloranthales R.Br. Chloranthaceae R.Br. ex Sims

Magnoliide Canellales Cronquist Canellaceae Mart. Winteraceae R.Br. ex Lindl. Piperales Bercht. & J.Presl Aristolochiaceae Juss. Hydnoraceae C.Agardh Lactoridaceae Engl. Piperaceae Giseke Saururaceae F.Voigt Laurales Juss. ex Bercht. & J.Presl Atherospermataceae R.Br. Calycanthaceae Lindl. Gomortegaceae Reiche Hernandiaceae Blume Lauraceae Juss. Monimiaceae Juss. Siparunaceae Schodde Magnoliales Juss. ex Bercht. & J.Presl Annonaceae Juss. Degeneriaceae I.W.Bailey & A.C.Sm. Eupomatiaceae Orb. Himantandraceae Diels Magnoliaceae Juss. Myristicaceae R.Br.

Monokotiledone Acorales Link Acoraceae Martinov Alismatales R.Br. ex Bercht. & J.Presl §Alismataceae Vent. (uključujući Limnocharitaceae Takht. ex Cronquist) Aponogetonaceae Planch. Araceae Juss. Butomaceae Mirb. Cymodoceaceae Vines Hydrocharitaceae Juss. Juncaginaceae Rich. Posidoniaceae Vines Potamogetonaceae Bercht. & J.Presl Ruppiaceae Horan. Scheuchzeriaceae F.Rudolphi Tofieldiaceae Takht. Zosteraceae Dumort. †Petrosaviales Takht. Petrosaviaceae Hutch. Dioscoreales R.Br. Burmanniaceae Blume Dioscoreaceae R.Br. Nartheciaceae Fr. ex Bjurzon Pandanales R.Br. ex Bercht. & J.Presl Cyclanthaceae Poit. ex A.Rich. Pandanaceae R.Br. Stemonaceae Caruel Triuridaceae Gardner Velloziaceae J.Agardh Liliales Perleb §Alstroemeriaceae Dumort. (uključujući Luzuriagaceae Lotsy) Campynemataceae Dumort. Colchicaceae DC. Corsiaceae Becc. Liliaceae Juss. Melanthiaceae Batsch ex Borkh. *Petermanniaceae Hutch. Philesiaceae Dumort. Ripogonaceae Conran & Clifford Smilacaceae Vent. Asparagales Link $Amaryllidaceae J.St.-Hil. (uključujući Agapanthaceae F.Voigt, Alliaceae Borkh.) $Asparagaceae Juss. (including Agavaceae Dumort., Aphyllanthaceae Burnett, Hesperocallidaceae Traub, Hyacinthaceae Batsch ex Borkh., Laxmanniaceae Bubani, Ruscaceae M.Roem., Themidaceae Salisb.) Asteliaceae Dumort. Blandfordiaceae R.Dahlgren & Clifford Boryaceae M.W.Chase, Rudall & Conran Doryanthaceae R.Dahlgren & Clifford Hypoxidaceae R.Br. Iridaceae Juss. Ixioliriaceae Nakai Lanariaceae R.Dahlgren & A.E.van Wyk Orchidaceae Juss. Tecophilaeaceae Leyb. $Xanthorrhoeaceae Dumort. (uključujući Asphodelaceae Juss. and Hemerocallidaceae R.Br.) Xeronemataceae M.W.Chase, Rudall & M.F.Fay

Commelinide Dasypogonaceae Dumort. Arecales Bromhead