Transmembranski protein 205 (TMEM205) je protein koji je kod ljudi kodiran genom TMEM205.
Gen TMEM205 nalazi se na minus lancu hromosoma 19 od baznog para 11,453.452 do 11,456.981. U neposrednoj blizini TMEM205, malo uzvodno, nalazi se CCDC159, a RAB3D je malo niže od genomske sekvence.
Protein Ljudski homolog TMEM205 dug je 189 aminokiselina i ima molekulsku težinu od 21,2 kDa. Sadrži četiri hidrofobna spiralna domena za koje se predviđa da su transmembranski domeni.
Aminokiselinska sekvenca Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
1020304050 MEEGGNLGGLIKMVHLLVLSGAWGMQMWVTFVSGFLLFRSLPRHTFGLVQ SKLFPFYFHISMGCAFINLCILASQHAWAQLTFWEASQLYLLFLSLTLAT VNARWLEPRTTAAMWALQTVEKERGLGGEVPGSHQGPDPYRQLREKDPKY SALRQNFFRYHGLSSLCNLGCVLSNGLCLAGLALEIRSL
Ekspresija Pokazalo se da se TMEM205 eksprimira u većim količinama u tkivima koja imaju sekretornu funkciju. Ta tkiva uključuju tkiva štitnjače, nadbubrežnih žlijezda, gušterače i mliječnih tkiva. Također se pokazalo da protein ispoljava pojačanu ekspresiju u tkivu tumora, koje je postalo otporno na hemoterapijske lijekove na bazi platine.
Funkcija Smatra se da je TMEM205 višeprolazni transmembranski protein. Pokazalo se da se u ljudskim tkivima nalazi na plazemamembrani i translocira se u jedarnu ovojnicu kad ćelije postanu otporne na cisplatin.[ Sadrži četiri domena za koje je TMHMM analizom predviđeno da će biti transmembranski domeni.
Homologija TMEM205 nema poznate paraloge u ljudskom genomu. Korištenje UCSC pretraživača genoma BLA prema sekvenci ljudskog proteina, utvrđeno je da je rod primata Galago najbliži čovjeku a koji sadrži paralog gena TMEM205 u svom genomu. TMEM205, međutim, ima širok raspon ortolognih sekvenci Rod – Vrsta Uobičajeno ime Divergencija sa ljudima (milioni godina) Pristup proteinu u bazi NCBI Sličnost sekvenci Dužina proteina Homo sapiens Ljudi 0 AAH91472.1 100% 189 Pan troglodytes Obični čimpanza 6,4 XP_003316117.1 100% 189 Pongo abelii Orangutan 15,8 NP 001124814.1 99% 189 Gorilla gorilla Gorila 8,8 XP_004060075.1 99% 189 Callithrix jacchus Obični marmozet 43,9 XP_002761800.1 96% 189 Mus musculus Miš 94,1 BAA92792764.1 88% 189 Sarcophilus harrisii Tasmanijski đavo 162,6 XP_003760487.1 77% 193 Crotalus adamanteus Zmija zvečarka 296 AFJ51753.1 85% 188 XenopusKandžasta žaba 371 NP_001037942.1 68% 189
Klinički značaj Pokazalo se da je TMEM205 uključen u rezistenciju na cisplatin. Cisplatin je hemoterapijski lijek, koji se obično koristi za liječenje solidnih malignih bolesti, kao što su karcinom, sarkom i limfom. Osim što je uključen u rezistenciju na cisplatin, sve je više dokaza da je protein također uključen u bolesti tiroiditis i prostatitis
Reference
Kategorija:Geni na hromosomu 19 Kategorija:Ljudski proteini