Vakuolni protein za sortiranje SNF8 je protein koji je kod ljudi kodiran genom SNF8.
SNF8, VPS25 i VPS36 formiraju ESCRT-II (endosomni kompleks za sortiranje potreban za transport II), kompleks koji je uključen u endocitozu ubikvitiniranih membranskih proteina. SNF8, VPS25 i VPS36 povezani su također u multiproteinskom kompleksu sa faktorom produženja RNK-polimeraze II.
Dužina polipeptidnog lanca je 258 aminokiselina, a molekulska težina 28.864.,
Aminokiselinska sekvenca Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
1020304050 MHRRGVGAGAIAKKKLAEAKYKERGTVLAEDQLAQMSKQLDMFKTNLEEF ASKHKQEIRKNPEFRVQFQDMCATIGVDPLASGKGFWSEMLGVGDFYYEL GVQIIEVCLALKHRNGGLITLEELHQQVLKGRGKFAQDVSQDDLIRAIKK LKALGTGFGIIPVGGTYLIQSVPAELNMDHTVVLQLAEKNGYVTVSEIKA SLKWETERARQVLEHLLKEGLAWLDLQAPGEAHYWLPALFTDLYSQEITA EEAREALP
Kloniranje i ekspresija Schmidt et al. (1999) pročistili su kompleks koji sadrži Ell iz ekstrakata jetre pacova, a sekvenciranjem peptida i analizom baze podataka EST dobili su cDNK pune dužine koja kodira SNF8, koju su nazvali EAP30. Izvedeni protein sadrži 258 aminokiselina. Otkrili su da bi rekombinantni EAP30 mogao imati interakciju s rekombinantnim ELL in vitro i derepresirati inhibitornu aktivnost ELL protiv RNK-polimeraze II.Schmidt, A. E., Miller, T., Schmidt, S. L., Shiekhattar, R., Shilatifard, A. Cloning and characterization of the EAP30 subunit of the ELL complex that confers derepression of transcription by RNA polymerase II. J. Biol. Chem. 274: 21981-21985, 1999. [PubMed]: 10419521
Koristeći mišje proteine eksprimirane u ćelijama sisara i insekata, Kamura et. (2001) otkrili su da se Eap30 i Eap20 (VPS25) mogu koimunoprecipitirati u odsustvu Eap45 (VPS36), a da se Eap20 i Eap45 mogu koimunoprecipitirati u odsustvu Eap30. Međutim, mali Eap30 koimunoprecipitiran je sa Eap45 u odsustvu Eap20. Zaključili su da EAP20 premošćuje EAP30 i EAP45 i time nukleira sklop EAP kompleksa.Kamura, T., Burian, D., Khalili, H., Schmidt, S. L., Sato, S., Liu, W.-J., Conrad, M. N., Conaway, R. C., Conaway, J. W., Shilatifard, A. Cloning and characterization of ELL-associated proteins EAP45 and EAP20: a role for yeast EAP-like proteins in regulation of gene expression by glucose. J. Biol. Chem. 276: 16528-16533, 2001. [PubMed]: 11278625
Mapiranje Međunarodni radijacijski konzorcij za mapiranje hibrida, mapirao je gen SNF8 na hromosom 17 (D17S1827).Slagsvold, T., Aasland, R., Hirano, S., Bache, K. G., Raiborg, C., Trambaiolo, D., Wakatsuki, S., Stenmark, H. Eap45 in mammalian ESCRT-II binds ubiquitin via a phosphoinositide-interacting GLUE domain. J. Biol. Chem. 280: 19600-19606, 2005. [PubMed]: 15755741
Životinjski model +Fenotip nokaut-miša Pnpo Svojstvo Fenotip Vijabilnost homozigota Nenormalno Studija recesivne letalnostiNenormalno Plodnost Normalno Tjelesna težina Normalno Test otvorenog polja: anksioznost Normalno Neurološka procjenaNormalno Snaga stiskaNormalno Test vruće ploče Normalno Dismorfologija Normalno Indirektna kalorimetrija Normalno Test tolerancije glukoze Normalno Slušni odgovor moždanog stabla Normalno DEXA Normalno Radiografija Normalno Tjelesna temperatura Normalno Morfologija ika Normalno Klinička hemija (nalaz)Normalno Plazmatski imunoglobulini Normalno Hematologija Normalno Leukociti periferne krvi Normalno Mikronukleus test Normalno Težina srca Normalno Histopatologija oka Normalno Salmonella infekcija Normalno Citrobacter infekcija NormalnoSvi testovi i analize su iz Mouse Resources Portal, Wellcome Trust Sanger Institute. U proučavanju PNPO funkcije, korišteni su modelni organizmi. Uvjetna linija nokaut-miševa, zvana Pnpotm1a (KOMP) Wtsi, generirana je kao dio programa Međunarosnog konzorcija za miševe – visokopropusnog projekta mutageneze za generiranje i distribuciju životinjskih modela bolesti zainteresiranim naučnicima.
Muške i ženske životinje prolazile su standardizirani fenotipski skrining, kako bi se utvrdili efekti delecije. Od 24 izvedena testa ina mutantnim miševima, uočene su dvije značajne abnormalnosti. Tokom gestacije, nije utvrđen homozigotni mutantni embrion, pa tako nijedan nije preživio do odvikavanja. Preostali testovi su izvedeni na mutiranim heterozigotnim odraslim miševima; nisu opažene nikakve dodatne značajne abnormalnosti kod ovih životinja.
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 17 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika