Ribosomni L1 domen-sadržavajući protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom RSL1D1.
Ma et al. (2008) izvijestili su da se gen RSL1D1 nalazi na kratkom (p) kraku hromosoma 16, pozicija 16p13.Ma, L., Chang, N., Guo, S., Li, Q., Zhang, Z., Wang, W., Tong, T. CSIG inhibits PTEN translation in replicative senescence. Molec. Cell. Biol. 28: 6290-6301, 2008. PubMed: 18678645
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 490 aminokiselina, a molekulska težina 54.973 Da.
Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin
H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
1020304050 MEDSASASLSSAAATGTSTSTPAAPTARKQLDKEQVRKAVDALLTHCKSR KNNYGLLLNENESLFLMVVLWKIPSKELRVRLTLPHSIRSDSEDICLFTK DEPNSTPEKTEQFYRKLLNKHGIKTVSQIISLQTLKKEYKSYEAKLRLLS SFDFFLTDARIRRLLPSLIGRHFYQRKKVPVSVNLLSKNLSREINDCIGG TVLNISKSGSCSAIRIGHVGMQIEHIIENIVAVTKGLSEKLPEKWESVKL LFVKTEKSAALPIFSSFVSNWDEATKRSLLNKKKKEARRKRRERNFEKQK ERKKKRQQARKTASVLSKDDVAPESGDTTVKKPESKKEQTPEHGKKKRGR GKAQVKATNESEDEIPQLVPIGKKTPANEKVEIQKHATGKKSPAKSPNPS TPRGKKRKALPASETPKAAESETPGKSPEKKPKIKEEAVKEKSPSLGKKD ARQTPKKPEAKFFTTPSKSVRKASHTPKKWPKKPKVPQST
Kloniranje i ekspresija Supresivnom subtraktivnom hibridizacijom za identifikaciju proteina smanjenih s replikativnom senescencijom u 2BS ljudskim diploidnim fibroblastima, nakon čega slijedi PCR amplifikacija, Ma et al. (2008) klonirali su RSL1D1, koji su nazvali CSIG. Izvedeni protein s 490 aminokiselina ima N-terminalni ribosomski L1 (MRPL1) domen i C-terminalni domen bogat lizinom. Northern blot analiza otkrila je varijabilnu ekspresiju CSIG u većini ispitivanih ljudskih tkiva, s najvećom ekspresijom u srcu, skeletnim mišićima i posteljici, a malo ili nimalo u mozgu, debelom crijevu i timusu. Endogeni CSIG lokaliziran je pretežno na jedarcetu u 2BS i ćelijama HeLa, frakcioniran polimerima ćelija HEK293. Western blot analizom otkriven je CSIG pri prividnoj molekulskoj masi od 55 kD.
Funkcija gena UPA (PLAU) je proteaza vanćelijskog matriksa koja je uključena u migraciju ćelija. Korištenjem 1-hibridnog mjesta kvasca i EMSA-e, Tong et al. (2005) otkrili su da je RSL1D1, ili PBK1, povezao pojačivač u promotoru UPA, između dva AP1-lokusa. Eksperimenti prekomjerne ekspresije i nokdauna sa ćelijskim linijama ljudskog karcinoma pluća 95D potvrdili su da je PBK1 pojačavao ekspresiju UPA, vezivanjem za pojačivač.Tong, C., Tan, L., Li, P., Zhu, Y.-S. Identification of a novel nucleus protein involved in the regulation of urokinase in 95D cells. Acta Biochim. Biophys. Sinica 37: 303-309, 2005. Ma et al. (2008) otkrili su da prekomjerna ekspresija CSIG u 2BS fibroblastima pospješuje rast ćelija, povećava broj ćelika u S fazi i odgađa starenje. Suprotno tome, utišavanje CSIG-a pomoću male ometajuće RNK usporilo je rast ćelija, smanjilo broj ćelija u S i G2 /M fazama i ubrzalo ćelijsko starenje. Analize gena reportera i Western blot analiza otkrile su da su CSIG negativno regulirali PTEN i njegov efektor p27 (KIP1) (CDKN1B), a oba su potrebna za replikativno starenje. Studije vezivanja pokazale su da je CSIG stupio u interakciju sa određenim segmentom PTEN-ovog 5-UTR-a, moguće indirektno i smanjio regulaciju PTEN-translacije, što je rezultiralo destabilizacijom p27 (KIP1). Ekspresija PTEN-a bila je presudna za CSIG-ovisnu ekspresiju p27 (KIP1) i napredovanje ćelijskog ciklusa.
Struktura gena Ma et al. (2008) utvrdili su da gen RSL1D1 sadrži devet egzona i obuhvata 5,1 kb.
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 16 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika