Neuređeni RING protein cinkovog prsta je protein koji je kod ljudi kodiran genom UNKL.
Patricia Hartz (2017) mapirala je gen UNKL u hromosomskoj regiji 16p13.3, na osnovu poravnanja UNKL sekvence (GenBank AK022685) sa genomskom sekvencom (GRCh38).
Kloniranje i ekspresija Korištenje aktiviranog mutanta RAC1 kao sonde u 2-hibridnom skriningu Jurkat biblioteke cDNK ljudskih T-ćelija, nakon čega je uslijedilo nekoliko rundi 5-baznog RACE-a s leukocitima ljudske periferne krvi, Lores et al. (2010) klonirali UNKL, koji su nazvali UNKL. Izvedeni protein s 680 aminokiselina ima ćetiri cinkova prsta u N-terminalnom području i domenu prstenastih prstiju blizu C-kraja. UNKL ima 87%, odnosno 40% identiteta sa ortolozima miša i roda Drosophila. Northern blot analiza otkrila je sveprisutnu ekspresiju transkripta od 4,4 kb u tkivima miša. Epitop označen UNKL bio je pretežno lociran u citosolu transficiranih HeLa ćelija, ali inhibicija eksporta jedarne energije rezultirala je jedarnom akumulacijom UNKL.Lores, P., Visvikis, O., Luna, R., Lemichez, E., Gacon, G. The SWI/SNF protein BAF60b is ubiquitinated through a signalling process involving Rac GTPase and the RING finger protein Unkempt. FEBS J. 277: 1453-1464, 2010. PubMed: 20148946
Funkcija gena Primjenom GST padajućeg test, Lores et al. (2010) potvrdili su interakciju između aktiviranog RAC-a i izoliranog C-terminala ljudskog UNKL-a, uključujući RING domen cinkovog prsta. Krajnji dio UNKL C nije stupio u interakciju sa RAC1 pune dužine, koji je pretežno bio u obliku vezanom za BDP, niti s bilo kojom drugom testiranom malom GTPazom. C-terminalna regija UNKL-a bila je ubikvitinirana u nekoliko ljudskih ćelijskih linija, a ubikvitinacija je pojačana aktiviranim RAC1. Delecija RING domena mišjeg cinkocog prsta Unkl poboljšala je njegovu sveprisutnost. C-terminalno područje UNKL-a stupilo je u interakciju sa SWI/SNF-om podjedinicom kompleksa za preoblikovanje hromatina BAF60B, u 2-hibridnoj analizi biblioteke cDNK posteljice. UNKL nije komunicirao s drugim ispitivanim podjedinicama BAF-a. Ekspresije regijw C-terminala UNKL poboljšale je ubikvitinaciju BAF60B, a kratko razlaganje UNKL-a posredovano ukosnicama smanjilo je ubikvitinaciju BAF60B.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 680 aminokiselina, a molekulska težina 73.828 Da.. Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
1020304050 MPSVSKAAAAALSGSPPQTEKPTHYRYLKEFRTEQCPLFSQHKCAQHRPF TCFHWHFLNQRRRRPLRRRDGTFNYSPDVYCSKYNEATGVCPDGDECPYL HRTTGDTERKYHLRYYKTGTCIHETDARGHCVKNGLHCAFAHGPLDLRPP VCDVRELQAQEALQNGQLGGGEGVPDLQPGVLASQAMIEKILSEDPRWQD ANFVLGSYKTEQCPKPPRLCRQGYACPHYHNSRDRRRNPRRFQYRSTPCP SVKHGDEWGEPSRCDGGDGCQYCHSRTEQQFHPESTKCNDMRQTGYCPRG PFCAFAHVEKSLGMVNEWGCHDLHLTSPSSTGSGQPGNAKRRDSPAEGGP RGSEQDSKQNHLAVFAAVHPPAPSVSSSVASSLASSAGSGSSSPTALPAP PARALPLGPASSTVEAVLGSALDLHLSNVNIASLEKDLEEQDGHDLGAAG PRSLAGSAPVAIPGSLPRAPSLHSPSSASTSPLGSLSQPLPGPVGSSAMT PPQQPPPLRSEPGTLGSAASSYSPLGLNGVPGSIWDFVSGSFSPSPSPIL SAGPPSSSSASPNGAELARVRRQLDEAKRKIRQWEESWQQVKQVCDAWQR EAQEAKERARVADSDRQLALQKKEEVEAQVIFQLRAKQCVACRERAHGAV LRPCQHHILCEPCAATAPECPYCKGQPLQW
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 16 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika