Duga međugenska protein-nekodirajuća iRNK 926 je protein koji je kod ljudi kodiran genom LINC00926 .
Prethodni izvještaj pokazao je da bi LINC00926 mogao biti uključen u suzbijanje metastaza raka dojke. Međutim, studije u vezi s funkcijom LINC00926 kod adenokarcinoma pluća su rijetke.
Postoje podaci o 10 sekvenciranja jednolančane RNK(scRNA-seq) za osam zdravih plućnih tkiva i pet tkiva plućnog adenokarcinoma. Sekvenca LINC00926 dobijena je iz baze Noncode (http://www.noncode.org/ ), a ćelijsku lokaciju lncRNA-a je predvidio lncLocator (http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/lncLocator/ ). Ciljanu miRNK lncRNK je predvidio Starbase (http://starbase.sysu.edu.cn/ ). Ciljne gene miRNK predvidio je miRDB (http://mirdb.org/). Funkcionalnu anotaciju ciljnih gena napravio je DAVID (https://david.ncifcrf.gov/ ). Ukupni opstanak pacijenata u TCGA-LUAD sa različitim nivoom ekspresije LINC00926 upoređivao je GEPIA (http://gepia.cancer-pku.cn/).
LINC00926 je specifično eksprimiran u B-ćelijama u adenokarcinomu pluća. Međutim, LINC00926 nije eksprimiran u B-ćelijama u normalnim plućima. LINC00926 se uglavnom nalazio u citoplazmi, što sugerira da bi mogao funkcionisati kao RNK-spužva. LINC00926 može vezati mikroRNK hsa-miR-3194-5p. Ciljni geni hsa-miR-3194-5p obogaćeni su terminma genske ontologije (GO) kao što su ćelijski spoj, vezivanje protein-kinaze i putevi Kjotske enciklopedije gena i genoma (KEGG), kao što je Ras signalni put. Visoka ekspresija LINC00926 povezana je s boljim ukupnim preživljavanjem pacijenata sa adenokarcinomom pluća.
Prema tome, LINC00926 može biti marker specifičan za B-ćelije i možda će imati zaštitnu ulogu kod pacijenata sa adenokarcinomom pluća. Potrebna su dalja istraživanja kako bi se istražilo kako LINC00926 funkcionira kod pacijenata sa adenokarcinomom pluća.https://www.jto.org/article/S1556-0864(21)01853-0/11P LINC00926 is a B cell-specific long non-coding RNA in lung adenocarcinoma and is associated with the prognosis of patients with this disease - Journal of Thoracic Oncology (jto.org)
Reference
Kategorija:Geni na hromosomu 15 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika