SCAMP2

Sekretorni membranski protein povezan sa nosačem 2 je protein koji je kod ljudi kodiran genom SCAMP2. Međunarodni konzorcij za radijacijsku hibridizacijumapirao je gen SCAMP2 na hromosomu 15 (sts-W74766).

Ovaj genski proizvod pripada porodici proteina SCAMP, koji su sekretorni nosači, membranski proteini. Oni funkcioniraju kao nosači površine ćelije u putevima recikliranja nakon Golgijevog aparata. Različiti članovi porodice su srodni proizvodi različitih gena i obično su eksprimirani zajedno. Ova otkrića sugeriraju da SCAMP-ovi mogu funkcionirati na istom mjestu tokom transporta vezikula, umjesto na odvojenim putovima.

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 329 aminokiselina, a molekulska težina 36.649 Da.. 1020304050 MSAFDTNPFADPVDVNPFQDPSVTQLTNAPQGGLAEFNPFSETNAATTVP VTQLPGSSQPAVLQPSVEPTQPTPQAVVSAAQAGLLRQQEELDRKAAELE RKERELQNTVANLHVRQNNWPPLPSWCPVKPCFYQDFSTEIPADYQRICK MLYYLWMLHSVTLFLNLLACLAWFSGNSSKGVDFGLSILWFLIFTPCAFL CWYRPIYKAFRSDNSFSFFVFFFVFFCQIGIYIIQLVGIPGLGDSGWIAA LSTLDNHSLAISVIMMVVAGFFTLCAVLSVFLLQRVHSLYRRTGASFQQA QEEFSQGIFSSRTFHRAASSAAQGAFQGN Simboli

C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin

Kloniranje i ekspresija Singleton et al. (1997) pojačali su SCAMP2 pomoću PCR-a, koristeći prajmere dizajnirane od SCAMP1. Klonirali su cDNK pune dužine iz cDNK biblioteke HeLa ćelijeđa. Također su identificirali SCAMP3 kao još jedan paralog u ćelijskoj biblioteci HeLa. SCAMP2 kodira izvedeni protein od 329 aminokiselina s izračunatom molekulskom masom od 36,6 kD. Protein dijeli strukturne karakteristike sa SCAMP1 i SCAMP3, uključujući segment sličan leucinskom zatvaraču, element bogat prolinom, prošireno središnje jezgro koju uključuječetiri navodna transmembranska domena, polarni segment i C-kraj bogat alaninom. SCAMP2 dijeli 54% i 56% ukupnog identiteta sekvence sa SCAMP1, odnosno SCAMP3, odnosno 94% identiteta s mišjim homologom. Najrazličitija područja su u N-kraji. Northern blot analizom otkriven je transkript SCAMP2 od 1,3 kb, s najvećom ekspresijom u srcu, posteljici i skeletnim mišićima, srednjom ekspresijom u plućima, gušterači i jetri i niskom ekspresijom u mozgu i bubrezima. Imunofluorescentna lokalizacija u HeLa ćelijama pokazala je tačkasta obojenja sa određenim perinuklearnim i perifernim obogaćivanjem, te djelimičnu kolokalizaciju sa SCAMP1 i SCAMP3.Singleton, D. R., Wu, T. T., Castle, J. D. Three mammalian SCAMPs (secretory carrier membrane proteins) are highly related products of distinct genes having similar subcellular distributions. J. Cell Sci. 110: 2099-2107, 1997. PubMed: 9378760

Reference

Dopunska literatura

Vanjski linkovi

Kategorija:Geni na hromosomu 15 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika