YY1-pridruženi faktor 2 je protein koji je kod ljudi kodiran genom YAF2. Gen YAF2 mapiran je na hromosomu 12q12, na osnovu poravnavanja sekvence YAF2 (GenBank BC037777) sa genomskom sekvencom (GRCh38).
Protein kodiran ovim genom stupa u interakciju s YY1, proteinom cinkovog prsta, koji je uključen u negativnu regulaciju gena ograničenih na mišiće. Sam ovaj genski proizvod sadrži jedan N-terminalni C2-X10-C2 cinkov prst, i za razliku od YY1, nsdreguliran je tokom miogene diferencijacije. Također olakšava proteolitsko cijepanje YY1 pomoću proteaze aktivirane kalcijem, m-kalpaina, sugerirajući mehanizam pomoću kojeg ovaj protein antagonizira negativaom učinku YY1.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 180 aminokiselina, a molekulska težina 19.901 Da.
1020304050 MGDKKSPTRPKRQPKPSSDEGYWDCSVCTFRNSAEAFKCMMCDVRKGTST RKPRPVSQLVAQQVTQQFVPPTQSKKEKKDKVEKEKSEKETTSKKNSHKK TRPRLKNVDRSSAQHLEVTVGDLTVIITDFKEKTKSPPASSAASADQHSQ SGSSSDNTERGMSRSSSPRGEASSLNGESH Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Koristeći YY1 kao sondu u 2-hibridnom kvascu, Kalenik et al. (1997) klonirali YAF2 iz biblioteke cDNK mišića. Izvedeni protein od 180 aminokiselina ima izračunatu molekulsku masu od oko 20 kD. Sadrži N-terminalni motiv cinkovog prsta tipa C2-X10-C2, gdje je X bilo koja aminokiselina, i navodni signal jedarne lokalizacije. YAF2 dijeli homologiju ograničene sekvence s nekoliko nukleoporina i RAN-vezujućeg proteina-2 (RANBP2).Kalenik, J. L., Chen, D., Bradley, M. E., Chen, S.-J., Lee, T.-C. Yeast two-hybrid cloning of a novel zinc finger protein that interacts with the multifunctional transcription factor YY1. Nucleic Acids Res. 25: 843-849, 1997. PubMed: 9016636
Prema Northern blot analizi, Sawa et al. (2002) otkrili su ekspresiju YAF2 u mnogim tkivima, s najvećom ekspresijom u srcu i skeletnim mišićima. Uočili su homologiju između YAF2 i RYBP, posebno unutar njihovih N-terminalnih domena.Sawa, C., Yoshikawa, T., Matsuda-Suzuki, F., Delehouzee, S., Goto, M., Watanabe, H., Sawada, J., Kataoka, K., Handa, H. YEAF1/RYBP and YAF-2 are functionally distinct members of a cofactor family for the YY1 and E4TF1/hGABP transcription factors. J. Biol. Chem. 277: 22484-22490, 2002. PubMed: 11953439
Funkcija gena Kalenik et al. (1997.) utvrdili su da dva prva cinkova prsta YY1 vežu YAF2. Razina YAF2 iRNK povećala se tokom in vitro diferencijacije ćelija skeleta i srčanog mišića pacova, za razliku od smanjene regulacije YY1. Prekomjerna ekspresija YAF2 u ćelijama mišjih mioblasta stimulirala je aktivnost miogenog promotora. Kotransfekcija i ekspresija YY1 u ovim ćelijama preokrenuli su stimulacijski učinak YAF2. YAF2 je također povećao proteolitsko cijepanje YY1 kalcija – aktiviranom proteazom m-kalpaina.
Kotransfekcijom i ekspresijom YAF2, GABPA i GABPB u ćelijama insekata, Sawa et al. (2002) utvrdili su da je YAF2 transkripcijski koaktivator za GABP.
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 12 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika