Lizin-specifična demetilaza 2A (KDM2A), znana i kao F-boksni i lucinlm bogati ponavljajući protein 11 (FBXL11) je enzim koji je kod ljudi kodiran genom KDM2A. KDM2A je član natporodice alfa-ketoglutarat-zavisnih hidroksilaza, koje su proteini koji ne sadrže hem i sadrže gvožđe.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 1.162 aminokiseline, a molekulska težina 132.793 Da..
1020304050 MEPEEERIRYSQRLRGTMRRRYEDDGISDDEIEGKRTFDLEEKLHTNKYN ANFVTFMEGKDFNVEYIQRGGLRDPLIFKNSDGLGIKMPDPDFTVNDVKM CVGSRRMVDVMDVNTQKGIEMTMAQWTRYYETPEEEREKLYNVISLEFSH TRLENMVQRPSTVDFIDWVDNMWPRHLKESQTESTNAILEMQYPKVQKYC LMSVRGCYTDFHVDFGGTSVWYHIHQGGKVFWLIPPTAHNLELYENWLLS GKQGDIFLGDRVSDCQRIELKQGYTFVIPSGWIHAVYTPTDTLVFGGNFL HSFNIPMQLKIYNIEDRTRVPNKFRYPFYYEMCWYVLERYVYCITNRSHL TKEFQKESLSMDLELNGLESGNGDEEAVDREPRRLSSRRSVLTSPVANGV NLDYDGLGKTCRSLPSLKKTLAGDSSSDCSRGSHNGQVWDPQCAPRKDRQ VHLTHFELEGLRCLVDKLESLPLHKKCVPTGIEDEDALIADVKILLEELA NSDPKLALTGVPIVQWPKRDKLKFPTRPKVRVPTIPITKPHTMKPAPRLT PVRPAAASPIVSGARRRRVRCRKCKACVQGECGVCHYCRDMKKFGGPGRM KQSCVLRQCLAPRLPHSVTCSLCGEVDQNEETQDFEKKLMECCICNEIVH PGCLQMDGEGLLNEELPNCWECPKCYQEDSSEKAQKRKMEESDEEAVQAK VLRPLRSCDEPLTPPPHSPTSMLQLIHDPVSPRGMVTRSSPGAGPSDHHS ASRDERFKRRQLLRLQATERTMVREKENNPSGKKELSEVEKAKIRGSYLT VTLQRPTKELHGTSIVPKLQAITASSANLRHSPRVLVQHCPARTPQRGDE EGLGGEEEEEEEEEEEDDSAEEGGAARLNGRGSWAQDGDESWMQREVWMS VFRYLSRRELCECMRVCKTWYKWCCDKRLWTKIDLSRCKAIVPQALSGII KRQPVSLDLSWTNISKKQLTWLVNRLPGLKDLLLAGCSWSAVSALSTSSC PLLRTLDLRWAVGIKDPQIRDLLTPPADKPGQDNRSKLRNMTDFRLAGLD ITDATLRLIIRHMPLLSRLDLSHCSHLTDQSSNLLTAVGSSTRYSLTELN MAGCNKLTDQTLIYLRRIANVTLIDLRGCKQITRKACEHFISDLSINSLY CLSDEKLIQKIS
Funkcija
Ovaj gen kodira člana porodice proteinska F-kutija koju karakterizira približno 40 aminokiselinskih motiva, F-kutija. Proteini F-kutije čine jednu od četiri podjedinice kompleksa ubikvitin protein-ligaze pod nazivom SCF (SKP1-kulin-F-kutija), koji funkcioniraju u fosforilaciji-zavisnoj sveprisutnoj upotrebi. Proteini F-boksa su podijeljeni u tri klase: Fbws koji sadrže domene WD-40, Fbls koji sadrže ponavljanja bogata leucinom i Fbx koji sadrže ili različite module interakcije protein-protein ili bez prepoznatljivih motiva. Protein kodiran ovim genom pripada klasi Fbls i, osim F-boks-a, sadrži najmanje šest visoko degeneriranih ponavljanja bogatih leucinom.
FBXL11/KDM2A je histon H3 lizin 36 demetilazni enzim. Enzimska aktivnost FBXL11/KDM2A oslanja se na konzervirani domen JmjC u N-kraju proteina koji koordinira gvožđe i alfaketoglutarat, kako bi katalizirao demetilaciju putem mehanizam zasnovanog na hidroksilaciji. Nedavno je pokazano da domen koji veže ZF-CxxC DNK unutar FBXL11/KDM2A ima sposobnost interakcije s nemetiliranom DNK i taj domen cilja FBXL11/KDM2A na otočnim regijama genoma CpG-a, gdje posebno uklanja metilacija histon H3-lizin 36. Ovaj mehanizam djeluje tako da stvara hromatinsko okruženje na CpG otocima koji ističe ove regulatorne elemente i razlikuje ih od neregulativnih regija u velikim složenim genomima sisara. U istraživanju na mišjim hepatocitima pokazalo se da ovaj gen regulira jetrenu glukoneogenezu.
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Ljudske 2OG oksigenaze Kategorija:EC 1.14.11 Kategorija:Geni na hromosomu 11 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika Kategorija:Enzimi