Recombinacijskoaktivacijki gen 1 znan i kao RAG-1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom RAG1.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 1.043 aminokiseline, a molekulska težina 119 097Da.
1020304050 MAASFPPTLGLSSAPDEIQHPHIKFSEWKFKLFRVRSFEKTPEEAQKEKK DSFEGKPSLEQSPAVLDKADGQKPVPTQPLLKAHPKFSKKFHDNEKARGK AIHQANLRHLCRICGNSFRADEHNRRYPVHGPVDGKTLGLLRKKEKRATS WPDLIAKVFRIDVKADVDSIHPTEFCHNCWSIMHRKFSSAPCEVYFPRNV TMEWHPHTPSCDICNTARRGLKRKSLQPNLQLSKKLKTVLDQARQARQHK RRAQARISSKDVMKKIANCSKIHLSTKLLAVDFPEHFVKSISCQICEHIL ADPVETNCKHVFCRVCILRCLKVMGSYCPSCRYPCFPTDLESPVKSFLSV LNSLMVKCPAKECNEEVSLEKYNHHISSHKESKEIFVHINKGGRPRQHLL SLTRRAQKHRLRELKLQVKAFADKEEGGDVKSVCMTLFLLALRARNEHRQ ADELEAIMQGKGSGLQPAVCLAIRVNTFLSCSQYHKMYRTVKAITGRQIF QPLHALRNAEKVLLPGYHHFEWQPPLKNVSSSTDVGIIDGLSGLSSSVDD YPVDTIAKRFRYDSALVSALMDMEEDILEGMRSQDLDDYLNGPFTVVVKE SCDGMGDVSEKHGSGPVVPEKAVRFSFTIMKITIAHSSQNVKVFEEAKPN SELCCKPLCLMLADESDHETLTAILSPLIAEREAMKSSELMLELGGILRT FKFIFRGTGYDEKLVREVEGLEASGSVYICTLCDATRLEASQNLVFHSIT RSHAENLERYEVWRSNPYHESVEELRDRVKGVSAKPFIETVPSIDALHCD IGNAAEFYKIFQLEIGEVYKNPNASKEERKRWQATLDKHLRKKMNLKPIM RMNGNFARKLMTKETVDAVCELIPSEERHEALRELMDLYLKMKPVWRSSC PAKECPESLCQYSFNSQRFAELLSTKFKYRYEGKITNYFHKTLAHVPEII ERDGSIGAWASEGNESGNKLFRRFRKMNARQSKCYEMEDVLKHHWLYTSK YLQKFMNAHNALKTSGFTMNPQASLGDPLGIEDSLESQDSMEF
Funkcija Geni RAG1 i RAG2 uglavnom su konzervirani kod ljudi. 55,99% i 55,98% kodiranih aminokiselina ne sadrže prijavljene varijante. Protei n kodiran ovim genom uključen je u antitijela i T-ćelijski receptor V (D) J rekombinacija. RAG-1 je uključen u prepoznavanje DNK supstrata, ali stabilna aktivnost vezivanja i cijepanja također zahtijeva RAG2. RAG-1/2 kompleks prepoznaje rekombinacijske signalne sekvence (RSS-ove) koji okružuju V, D i J regije u genima koji kodiraju teški i lahki lanci antitijela i komponenti receptora T-ćelija. Kompleks se veže za RSS ove i probija DNK. To dovodi do uklanjanja intervenirajuće DNK i konačne ligacije V, D i J sekvenci. Defekti ovog gena mogu uzrokovati nekoliko različitih bolesti.
Klinički značaj
Zbog ovih učinaka, delecija Rag1 koristi se u mišjim modelima bolesti za narušavanje razvoja T– i B-ćelija, te funkcionalno deletira zrele T i B ćelije iz imunkog ssistema.
Kod ljudi, nedostatak RAG-a prvi put prepoznat je kao oblik imunske disregulacije, poznat kao Omennov sindrom. Nedostatak RAG-a smatra se autosomno recesivnom bolešću. Poremećaj se općenito identificira kod dojenčadi. Potpuni gubitak funkcije u RAG1/2, glavne komponente odgovorne za rekombinacijsku aktivnost V (D) J, proizvodi ozbiljnu imunodeficijenciju kod ljudi. Hipomorfne varijante RAG-a mogu zadržati djelimičnu rekombinacijsku aktivnost i rezultira izrazitim fenotipom kombinovane imunodeficijencije sa granulomom i/ili autoimunitetom (CID-G/A). Nedostatak RAG-a može se mjeriti in vitro kvantifikacijom rekombinacijske aktivnosti. Do danas je funkcionalno ispitano 71 varijanta RAG1 i 39 RAG2 (manje od 10% potencijalnih tačkastih mutacija koje mogu uzrokovati bolest). Međutim, varijante najboljih kandidata rangirane su prema njihovoj predviđenoj kliničkoj važnosti.
Reference
Kategorija:Geni na hromosomu 11 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika