Protein KIAA1958 je protein koji je kod ljudi kodiran genom KIAA1958. Ortolozi KIAA1958 sežu u evoluciji do hordata, iako je u homologiji bliže primatima od bilo kojeg drugog ortologa. KIAA1958 nema poznatih paraloga.
Gen KIAA1958 nalazi se na dugom kraku hromosoma 9 (9.q32), kod ljudi na plus lancu, od 115249248. do 115427597. bp. Its mRNA has 2683 bp. U susjedstvu su mu ovi geni: thumb|left|300px|Susjedni geni KIAA1958
HSDL2: Protein 2 sličan hidroksisteroid dehidrogenazi 2 ima ulogu u vezivanju nukleotida, oksidoreduktaza i vezivanju sterola. C9orf147: otvoreni okvir čitanja 147 hromosoma 9 nema poznatih funkcija.
C9orf80: otvoreni okvir čitanja 80 hromosoma 9 j komponenta SOSS kompleksa, multiproteinskog kompleksa koji funkcionira nizvodno od MRN kompleksa za podsticanje popravki DNK i G2/M kontrolna tačka. SOSS kompleks povezuje se s jednolančanom DNK na njenim lezijama i utiče na različite krajnje tačke u ćelijskom odgovoru na oštećenje DNA, uključujući kontrolna tačka ćelijskog ciklusa, rekombinacijsko popravljanje i održavanje genomske stabilnosti.
SNX30: Sortiranje neksina-30 može biti povezano sa vezivanjem fosfatidilinositola.
Protein thumb|280px|Predviđena mjesta fosforilacija KIAA1958 KIAA1958 sadrži 716 aminokiselina s atomskom težimom os 79.212 Da i izoelektričnom tačkom od 6,375. Iako se o proteinu KIAA1958 ne zna mnogo, naučna su predviđanja napravljena pomoću superračunara za predviđanje strukture i funkcije KIAA1958. KIAA1958 prolazi posttranslacijske modifikacije. Najzanimljivija modifikacija je fosforilacija. U usporedbi s drugim proteinima, KIAA1958 ima značajno značajnu količinu fosfoliranih serina tokom posttranslacijske modifikacije. Predviđeno je fosforiliranje 36 serina.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 716 aminokiselina, а molekulska težina 79.212 Da. 1020304050 MEDCLHTSSENLSKLVSWAHSHGTICSLIPNLKHLLSEGSHGNLTAMWGC SAGHAYHWPLTATCRAGSQERVCFQDNRSFNSDSPSIIGVPSETQTSPVE RYPGRPVKAKLDCNRTRDSCDFSYCSEPSELDETVEEYEDENTLFDMVCE SSVTDEDSDFEPQTQRPQSIARKRPGVVPSSLHSSSQTQMVDECSNDVII KKIKQEIPEDYYIVANAELTGGVDGPALSLTQMAKPKPQTHAGPSCVGSA KLIPHVTSAISTELDPHGMSASPSVISRPIVQKTARVSLASPNRGPPGTH GTNQQVAMQMPVSTSHPNKQISIPLSALQLPGQDEQVASEEFLSHLPSQV SSCEVALSPSVNTEPEVSSSQQQPPVAPAITTEATAQCIPAYSTKLNKFP VFNINDDLNDLCTSAVSPNTTKATRYALNVWRYWCMTNGLKDHTDITKIP AVKLNELLENFYVTVKKSDGSDFLATSLHAIRRGLDRILKNAGVGFSITS STFSSSTKKLKEKLWVLSKAGMSGARSRNIVYFSLSDEEEMWQAGCLGDD SPITLLSTVVKYNSQYLNMRTLQEHADLMYGDIELLKDPQNQPYFARTDS VKRESRSGSTRVCHGKIYHEHSRGHKQCPYCLLYKYMYIHRPPTQMEAKS PFYLTARKEATDMGSVWYEEQRMGLRSLRGIVPNLAKKVKLENCENFTFV SFTQVSRRLGSHSCCQ
C: Cistein D: Aspartat E: Glutamat F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Struktura
PELE na SDSC Biology WorkBench je superračunar koji može predvidjeti sekundarnu strukturu proteina KIAA1958. Prema ovom alatu, sekundarna struktura KIAA1958 je kombinacija alfa-heliksa i beta-listova, u gotovo jednakim količinama i ravnomjerno raspoređena po proteinu.
Interakcije Još nema poznatih dokaza da KIAA1958 stupa u interakciju s bilo kojim drugim proteinom.
Ekspresija
KIAA1958 je u najvećim količinama eksprimiran u grkljanu, kako je predložio EST. Najjača ekspresija u postnatanom razvoju je i blastocistama, a zbog zdravstvenog stanja najviše se nalazi u tumorima maternice. Podaci prema NCBI GEO Profile pokazuje da ekspresija KIAA1958 uključuje mnoge tipovee tkiva u ljudskom tijelu. Koristeći EMBL-EBI, utvrđeno je da je KIAA1958 prekomjerno eksprimiran u RNK pseudopodija, tokom migracije ćelija metastatskog raka. KIAA1958 je također bio prekomjerno izražen u stat5/ab i stat 3, koji su transkripcijski faktori za koje se izvještava da su kritični za rast i održivost ćelija raka prostate i embrionskih matičnih ćelija i pluripotentnih matičnih ćelija.
Homologija Rod i vrsta Uobičajeno ime Pristupni broj Dužina sekvence Identitet sekvence Sličnost sekvence Pan troglodytes Čimpanza XM_528391 7945 bp 99% 99% Mus musculus Mouse BAC38268 719 a 97% 98% Callithrix jacchus Obični marmozet XM_002743204 2346bp 97% 82% Pongo abelii Sumatranski orangutan XM_002820112 1120bp 96% 4% Sus scrofaDivlja svinja XM_003122070 2502 bp 93% 81% Ailuropoda melanoleuca Gigantska panda XM_002925938 2151 bp 85% 91% Nomascus leucogenysBjeliobrazni gibon XM_003263945 950 bp 93% 5% Oryctolagus cuniculus Evropski kunić XM_002707990 2223 bp 93% 43% Loxodonta africana Afrički žbunasti slon XM_003407521 2388 bp 93% 80% Cricetulus griseus Kineski hrčak XM_003505508 2534 bp 92% 42% Equus caballus Konj XM_001916302 2536 bp 91% 93% Bos taurus Govedo XM_876102.5 2480 bp 91% 81% Rattus norvegicus Pacov XM_002726532 1364 bp 91% 36% Cavia porcellus Zamorčić XM_003463791 2217 bp 91% 43% Monodelphis domestica Oposum XM_001375976 2217 bp 78% 41% Branchiostoma floridae Kopljača XP_002611438 719 a 29% 48% Amphimedon queenslandica Sunđer XP_003390994 388 a 25% 48% Acyrthosiphon pisum Graškova uš XP_001943720 1197 aa 24% 43% Oikopleura dioica Hordata CBY34656 629 a 22% 43% Ciona intestinalis Peharasti tunikat XP_002125964 1004 aa 23% 43% Xenopus (silurana) tropicalisZapadna kandžasta žaba AAI61073 679 a 23% 43% Halocynthia roretzi Morski ananas BAB40645 980 a 23% 45%
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 9 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika