EGR-1 (skraćenica od engleskog naziva Early Growth Response protein 1 = protein odgovora na rani faktor rasta ) znan i kao ZNF268 (engleska skraćenica za protein cinkovog prsta 268) ili NGFI-A (engleska skraćenica za protein A induciran fakrorom rasta) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom EGR1.
EGR-1 je transkripcijski faktor. Nazvan je i Krox-24, TIS8 i ZENK. Prvobitno je otkriven kod miševa.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 543 aminokiselina, а molekulska težina 57.507 Da.
1020304050 MAAAKAEMQLMSPLQISDPFGSFPHSPTMDNYPKLEEMMLLSNGAPQFLG AAGAPEGSGSNSSSSSSGGGGGGGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHL TAESFPDISLNNEKVLVETSYPSQTTRLPPITYTGRFSLEPAPNSGNTLW PEPLFSLVSGLVSMTNPPASSSSAPSPAASSASASQSPPLSCAVPSNDSS PIYSAAPTFPTPNTDIFPEPQSQAFPGSAGTALQYPPPAYPAAKGGFQVP MIPDYLFPQQQGDLGLGTPDQKPFQGLESRTQQPSLTPLSTIKAFATQSG SQDLKALNTSYQSQLIKPSRMRKYPNRPSKTPPHERPYACPVESCDRRFS RSDELTRHIRIHTGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDI CGRKFARSDERKRHTKIHLRQKDKKADKSVVASSATSSLSSYPSPVATSY PSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPSPVHSGFPSPSVATTYS SVPPAFPAQVSSFPSSAVTNSFSASTGLSDMTATFSPRTIEIC
Funkcija
Protein kodiran ovim genom pripada porodici EGR proteina Cys2 njegovog tipacinkovog prsta2 To je jedarni protein i funkcionira kao regulator transkripcije. Proizvodi ciljnih gena koje aktivira potrebni su za diferencijaciju i mitogenezu. Studije sugeriraju da se radi o tumor-supresorskom genu.
Ima jasan obrazac ekspresije u mozgu, a pokazalo se da je njegova indukcija povezana s neuronskom aktivnošću. Nekoliko studija sugerira da ima ulogu u plastičnosti neurona.
EGR-1 je važan faktor transkripcije u formaciji memorija. Ima bitnu ulogu u reprogramiranju epigenetičkih moždanih neurona. EGR-1 regrutuje protein TET1 koji pokreće put demetilacije DNK.Sun Z, Xu X, He J, Murray A, Sun MA, Wei X, Wang X, McCoig E, Xie E, Jiang X, Li L, Zhu J, Chen J, Morozov A, Pickrell AM, Theus MH, Xie H. EGR1 recruits TET1 to shape the brain methylome during development and upon neuronal activity. Nat Commun. 2019 Aug 29;10(1):3892. doi: 10.1038/s41467-019-11905-3. PMID 31467272 Uklanjanje oznaka metilacije DNK omogućuje aktivaciju nizvodnih gena. EGR-1, zajedno s TET1, koristi se za programiranje distribucije mjesta metilacije DNK mozga tokom njegovog razvoja, u učenju i dugoročnoj neuronskom plastičnosti. Takođe je utvrđeno da EGR-1 regulira ekspresiju VAMP2 (proteina važnog za sinapsne egzocitoze).
Osim svoje funkcije u živčanom sistemu, postoje značajni dokazi da EGR-1 zajedno sa svojim paralogom EGR-2 inducira u fibroznim bolestima, ima ključne funkcije u fibrinogenezi i neophodan je za eksperimentalno induciranu fibrozu kod miševa.
Može biti uključen i u funkciju jajnika.
Struktura
Domen koji veže DNK EGR-1 sastoji se od tri domena cinkovog prsta tipa Cys2His2. Struktura aminokiselina EGR-1 domena cinkovog prsta data je u ovoj tabeli, koristeći jednoznačni kod aminokiselina. Prsti od 1 do 3 označeni su sa f1 - f3. Brojevi se odnose na ostatke (aminokiseline) alfa-helikse (nema nule). Ostaci označeni sa "x" nisu dio cinkovih prstiju, već služe za njihovo povezivanje. + -1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 x x x x x f1 M A E E R P Y A C P V E S C D R R F S R S D E L T R H I R I H T G Q K P f2 F Q C A I - - C M R N F S R S D H L T T H I A T H T G E K P f3 F A C D I - - C G R K F A R S D E R K R H T K I H L R Q K D
Simboli Alanin (Ala, A), Arginin (Arg, R), Asparagin (Asn, N), Aspartat (Asp, D), Cistein (Cys, C), Glutamat (Glu, E), Glutamin (Gln, Q), Glicin (Gly, G), Histidin (His, H), Izoleucin (Ile, I), Leucin (Leu, L), Lizin (Lys, K), Metionin (Met, M), Fenilalanin (Phe, F), Prolin (Pro, P), Serin (Ser, S), Treonin (Thr, T), Triptofan (Trp, W), Tirozin (Tyr, Y), Valin (Val, V)
Kristalna struktura DNK vezana domenom cinkovog prsta EGR-1 riješena je 1991. godine, što je uveliko pomoglo rano istraživanje u domenama vezanja DNK za cinkove prste.
Ljudski protein EGR-1 sadrži (u neobrađenom obliku) 543 aminokiselina molekulske mase 57,5 kDa, a gen se nalazi na hromosomu 5.
Specifičnost vezivanja DNK
EGR-1 veže DNK sekvencu 5'-GCG TGG GCG-3'(i slične 5'-GCG GGG GCG-3'). Položaj f1 veže 5 'G (prvi broj baze slijeva); položaj f1 3 prema drugoj bazi (C); pozicija f1 -1 veže se za treću poziciju (G); f2 položaj 6 do četvrte baze (T); i tako dalje.
Interakcije
Pokazalo se da EGR-1 stupa u interakcije sa: CEBPB, CREB-vezujući protein, EP300, NAB1, P53, i PSMA3
Također pogledajte Cinkov prst
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Molekularna neuronauka Kategorija:Transkripcijski faktori Kategorija:Cinkovi proteini Kategorija:Geni na hromosomu 5 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika