La-srodni protein 1 (LARP1) jest protein od kDa, koji je kod ljudi kodiran genom LARP1 sa hromosoma 5. LARP1 je nova sisarska meta na signalnom putu rapamicinskog kompleksa 1 (mTORC1), često hiperaktiviranog sklopa u karcinomu koji regulira rast i proliferaciju ćelija prvenstveno regulacijom sinteze proteina.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 1.096 aminokiselina, а molekulska težina 123.510 Da.
1020304050 MATQVEPLLPGGATLLQAEEHGGLVRKKPPPAPEGKGEPGPNDVRGGEPD GSARRPRPPCAKPHKEGTGQQERESPRPLQLPGAEGPAISDGEEGGGEPG AGGGAAGAAGAGRRDFVEAPPPKVNPWTKNALPPVLTTVNGQSPPEHSAP AKVVRAAVPKQRKGSKVGDFGDAINWPTPGEIAHKSVQPQSHKPQPTRKL PPKKDMKEQEKGEGSDSKESPKTKSDESGEEKNGDEDCQRGGQKKKGNKH KWVPLQIDMKPEVPREKLASRPTRPPEPRHIPANRGEIKGSESATYVPVA PPTPAWQPEIKPEPAWHDQDETSSVKSDGAGGARASFRGRGRGRGRGRGR GRGGTRTHFDYQFGYRKFDGVEGPRTPKYMNNITYYFDNVSSTELYSVDQ ELLKDYIKRQIEYYFSVDNLERDFFLRRKMDADGFLPITLIASFHRVQAL TTDISLIFAALKDSKVVEIVDEKVRRREEPEKWPLPPIVDYSQTDFSQLL NCPEFVPRQHYQKETESAPGSPRAVTPVPTKTEEVSNLKTLPKGLSASLP DLDSENWIEVKKRPRPSPARPKKSEESRFSHLTSLPQQLPSQQLMSKDQD EQEELDFLFDEEMEQMDGRKNTFTAWSDEESDYEIDDRDVNKILIVTQTP HYMRRHPGGDRTGNHTSRAKMSAELAKVINDGLFYYEQDLWAEKFEPEYS QIKQEVENFKKVNMISREQFDTLTPEPPVDPNQEVPPGPPRFQQVPTDAL ANKLFGAPEPSTIARSLPTTVPESPNYRNTRTPRTPRTPQLKDSSQTSRF YPVVKEGRTLDAKMPRKRKTRHSSNPPLESHVGWVMDSREHRPRTASISS SPSEGTPTVGSYGCTPQSLPKFQHPSHELLKENGFTQHVYHKYRRRCLNE RKRLGIGQSQEMNTLFRFWSFFLRDHFNKKMYEEFKQLALEDAKEGYRYG LECLFRYYSYGLEKKFRLDIFKDFQEETVKDYEAGQLYGLEKFWAFLKYS KAKNLDIDPKLQEYLGKFRRLEDFRVDPPMGEEGNHKRHSVVAGGGGGEG RKRCPSQSSSRPAAMISQPPTPPTGQPVREDAKWTSQHSNTQTLGK
Funkcija
LARP1 je najveći od sedam članova porodice proteina LARP (ostali su: LARP1B, LARP3 (poznat i kao originalni La ili SSB), LARP4A, LARP4B, LARP6 i LARP7). Svi LARP oni, uključujući ljudske LARP, sadrže po dva konzervirana područja. Prva konzervirana regija dijeli homologiju s La proteinima (naziva se La motiv, dok je druga konzervirana regija (nazvana LA-motiv) ograničena na LARP proteine. LARP1 i 1B takođe sadrže konzerviranu "DM15 regiju" unutar svog C-kraja. Ova regija je jedinstvena i pokazalo se da je potrebna za vezanje RNK. Mišji Larp1 eksprimiran je u dorzalnim korijenima ganglija i kičmenoj moždini, kao i u organima u razvoju koje karakteriziraju interakcije epitel-mezenhim. Ljudski LARP1 prisutan je u niskim razinama u normalnim, neembrionskim ćelijama, ali je visoko izražen u epitelnim karcinomima (kao što su na jajnicima, debelom crijevu, prostati, nemaloćelijski pluća, hepatoćelijski i grliću maternice). Neka istraživanja pokazala su da visoka razina proteina LARP1 korelira s lošijom prognozom kod pacijenata s rakom.
LARP1 se veže i regulira translaciju terminalnih oligopirimidinskih motiva (TOP iRNK) i može direktno stupiti u interakciju s 5' kap iRNK. Također je pokazano da stupa u interakciju s 3' krajem i kodirajućim regijama (CDS) ostalih gena. LARP1 protein kolokalizira sa stresnim granulama i P-tijelima, koji funkcioniraju u skladištenju i razgradnji RNK. Predloženo je da LARP1 funkcionira u P-tijelima, kako bi smanjio broj konzerviranih iRNK Ras-MAPK. Grupa homologa LARP1-a može funkcionirati u kontroli ekspresije ključnih razvojnih regulatora.
Nekoliko je studija pokazalo da nedostatak LARP1 selektivno utiče na regrutiranje TOP iRNK u polisomima. U nekim ćelijamama raka, nedostatak LARP1 smanjuje proliferaciju i aktivira apoptotsku ćelijsku smrt. Iako je prijavljeno smanjenje količine proteina kodiranih sa TOP iRNK u utišanim ćelijama LARP1, neki vjeruju da to može biti jednostavno objašnjeno smanjenim brojem TOP transkripata iRNK u ćelijama s nedostatkom LARP1.
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 5 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika