Institut Wellcome Sanger, prethodni naziv The Sanger Centre i Wellcome Trust Sanger Institute, je neprofitna britanska istraživačka institucija u oblasti genomike i genetike , koja se prvenstveno finansira iz fondacije Wellcome Trust.

Nalazi se u Wellcome Genome Campusu u selu Hinxton, izvan Cambridgea. Dijeli ovu lokaciju sa Evropskim institutom za bioinformatiku. Osnovan je 1992. godine i imenovan po dvojniku nobelovca Fredericka Sangera. Zamišljen je kao veliki centar za sekvenciranje DNK i učešće u Projektu ljudskog genoma, a dao je najveći pojedinačni doprinos zlatnoj standardnoj sekvenci ljudskog genoma. Institut je od svog osnivanja uspostavio i održavao politiku razmjena podataka, a veliki dio svog istraživanja provodi u saradnji.

Od 2000. godine Institut je proširio svoju misiju na razumijevanje „uloge genetike u zdravlju i bolestima ". Sada zapošljava oko 900 ljudi i fokusitran je na pet glavnih područja istraživanja: kancer, starenje i somatske mutacije, citogenetika, genetika čovjeka, paraziti i mikrobi, te filogenetsko stablo života.

Objekti i resursi

Kampus 320px|thumb|Kamus Wellcome Genome thumbnail|right|Komemorativni obojeni prozor koji se nalazi u Sulstonovoj zgradi Instituta Wellcome Sanger, u znak obilježavanja otvaranja Genomskog kampusa U 1993.,tada 17 zaposlenika Sanger centra preselilo se u privremeni laboratorijski prostor u Hinxton Hallu u Cambridgeireu. Ova lokacija od trebala je postati Wellcome Genome Campus, sa sve većom populacijom od oko 1.300 zaposlenih, od kojih približno 900 radi na Institutu Sanger. Genome Campus također uključuje konferencijski centar Wellcome Trust i Evropski institut za bioinformatiku. Veliko proširenje kampusa službeno je otvoreno 2005; u zgrade uselile su nove laboratorije <Centar baze podataka i eminentno osoblje. U diskusiji o imenu centra, Sanger (još živ kada je centar otvoren) rekao je Johnu Sulstonu, direktoru osnivača, da je "bolje da centar bude dobar". Sulston je komentirao: "Volio bih da nisam pitao."

Sekvenciranje Osoblje za sekvenciranje Instituta Sanger rukuje milionima uzoraka DNK svake sedmice. Institut "kapitalizira vrhunske tehnologije kako bi odgovorio na pitanja na koja nije bilo odgovora rije samo nekoliko godina". Napredak tehnologije omogućava Institutu Sanger da izvrši sekvenciranje genoma pojedinačnih ljudi, kičmenjačkih vrsta i patogena, sve bržim tempom i smanjenjem troškova. Institut ima više od 100 projekata u sekvenciranju patogena. Ishod Instituta Sanger iznosi oko 10 milijardi baza sirovih podataka o sekvencama dnevno.

Naučni resursi 2015. Bioinformatički Izvori baza podataka jedan su od rezultata istraživačkih programa u kojima je uključen Institut Sanger. Oni čiji je domaćin Institut Sanger uključuju:

COSMIC, katalog somatskih kancerogenih mutacija DECIPHER, baza podataka o hromosomskoj neravnoteži i fenotipovima ljudi, koristeći Ensemblove resurse Ensembl, pretraživač genoma čiji je domaćin Evropski institut za bioinformatiku. GeneDB, baza podataka o sekvencama patogena Projekt genetike miševa, uključujući bazu podataka standardizirane fenotipske analize za mnoge stotine mutiranih miševa. Vega, izvor označavanja genoma kičmenjaka

Nekoliko baza podataka pokrenuto je na Institutu Sanger, ali su sada smještene na drugom mjestu:

MEROPS, baza podataka o peptidazama Pfam, a baza podataka o porodicama proteina Rfam, baza podataka o porodicama RNK TreeFam, baza podataka za filogenetska stabla životinjskih gena. WormBase,baza podataka o biologiji i sekvencama modelnih organizama C. elegans i ostalih srodnih Nematoda. WormBase ParaSite, baza podataka genomici parazitskih helminta (i Nematoda i Platyhelminthes).

Saradnja Veliki dio istraživanja Instituta Sanger provodi se u partnerstvu sa širom naučnom zajednicom; više od 90 posto istraživačkih radova instituta uključuje saradnju sa drugim organizacijama.Podaci zasnovani na podacima za 2008. preuzeti sa web stranice SCOPUS -a Značajne saradnje uključuju:

Projekat 1000 genoma GENCODE i ENCODE (ENciklopedija DNK elemenata) Međunarodni konzorcij za genom raka Međunarodni projekat HapMap Međunarodni konzorcij za nokaut-miševe Međunarodni konzorcij za fenotipiziranje miševa Konzorcij za SNP (jednonukleotidne polimorfizme) Projekt varijacije broja kopija Sekvenciranja genoma S. pombe, C. elegans, miševa i malarijskih parazita. Projekt ljudskog genoma Projekt 10.000 UK genoma (UK10K)UK10K (the UK 10,000 Genomes Project) Wellcome Trust – Alijansa Odsjek za biotrhnologiju, Indija http://www.wellcomedbt.org/Mini_symposium_final_poster_schedule.pdf

Projekt ljudskog genoma Institut Sanger otvoren je 1993., tri godine nakon početka rada Projekta ljudskog genoma, i dao je najveći pojedinačni doprinos zlatnoj standardnoj sekvenci ljudskog genoma, objavljenoj 2004. godine. Institut je sarađivao na sekvenci osam od 23 para ljudskih hromosoma: 1, 6, 9, 10, 13, 20, 22 i X). Od objavljivanja ljudskog genoma, istraživanja provedena na Institutu razvila su se dalje od sekvenciranja organizama u različita područja biomedicinskih nauka, uključujući studije o bolestima poput raka, malarije i dijabetesa.

References

Vanjski linkovi

Kategorija:Partnerske institucije Univerziteta u Cambridgeu Kategorija:Genetičko inženjertvo u Ujedinjenom Kraljevstvu Kategorija:Instituti za genetiku ili genomiku Kategorija:Istraživački instituti u Cambridgeshireu Kategorija:Partnerske instucije Univerzitrta u Cambridgeu Kategorija:Wellcome Trust