SLC22A5 je membranski transportni protein pridružen primarnom nedostatku karnitina. To jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SLC22A5 sa hromosoma 5. Ovaj protein je uključen u aktivno ćelijsko preuzimanje karnitina. Djeluje kao simporter, pomičući natrijeve ione i druge organske katikone preko membrane, zajedno s karnitinom. Takvi polispecifični organski kationski transporteri u jetri, bubrezima, crijevima i drugim organima kritični su za uklanjanje mnogih endogenih malih organskih kationa, kao i širokog spektra lijekova i toksina iz okoliša. Mutacije u genu SLC22A5 uzrokuju sistemski primarni nedostatak karnitina, što može dovesti do zatajenja srca.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 557 aminokiselina, а molekulska težina 62.752 Da.
1020304050 MRDYDEVTAFLGEWGPFQRLIFFLLSASIIPNGFTGLSSVFLIATPEHRC RVPDAANLSSAWRNHTVPLRLRDGREVPHSCRRYRLATIANFSALGLEPG RDVDLGQLEQESCLDGWEFSQDVYLSTIVTEWNLVCEDDWKAPLTISLFF VGVLLGSFISGQLSDRFGRKNVLFVTMGMQTGFSFLQIFSKNFEMFVVLF VLVGMGQISNYVAAFVLGTEILGKSVRIIFSTLGVCIFYAFGYMVLPLFA YFIRDWRMLLVALTMPGVLCVALWWFIPESPRWLISQGRFEEAEVIIRKA AKANGIVVPSTIFDPSELQDLSSKKQQSHNILDLLRTWNIRMVTIMSIML WMTISVGYFGLSLDTPNLHGDIFVNCFLSAMVEVPAYVLAWLLLQYLPRR YSMATALFLGGSVLLFMQLVPPDLYYLATVLVMVGKFGVTAAFSMVYVYT AELYPTVVRNMGVGVSSTASRLGSILSPYFVYLGAYDRFLPYILMGSLTI LTAILTLFLPESFGTPLPDTIDQMLRVKGMKHRKTPSHTRMLKDGQERPT ILKSTAF
Struktura Gen SLC22A5 ima 10 egzona,Online Mendelian Inheritance in Man, OMIM®. Johns Hopkins University, Baltimore, MD. MIM Number: {603377}: {04/29/2015}: . World Wide Web URL: https://omim.org/ nalazi se na q kraku hromosoma 5 u poziciji 31.1 i obuhvata 25.910 parova baza. Gen proizvodi protein od 63 kDa sa 557 aminokiselina. Protein ima 12 pretpostavljenih transmembranskih domena, sa dugom vanćelijskom petljom od 107 aminokiselina, između prve dva transmembranska domena i unutarćelijskom petljom između četvrtog i petog transmembranskog domena. Ova duga vanćelijska petlja ima tri potencijalna mjesta za N-glikozilaciju, a unutarćelijska petlja ima ATP/GTP vezujući motiv. U pretpostavljenim unutarćelijskim domenima postoji pet potencijalnih mjesta za fosforilaciju ovisne o protein-kinazi C i jedno za fosforilaciju ovisnu o protein-kinazi A.
Funkcija Gen SLC22A5 kodira plazmatski integralni membranski protein koji funkcionira i kao transporter organskih kationa i transporter visokog afiniteta karnitina ovisnog o natriju. Kodirani protein uključen je u aktivno ćelijsko preuzimanje karnitina, prenoseći jedan natrijev ion s jednom molekulom karnitina. Organski kationi koji se prenose ovim proteinom uključuju tetraetilamonij (TEA) bez uključivanja natrija. Odnos relativne aktivnosti preuzimanja karnitina i TEA je 11,3.
Klinički značaj Glavni fenotipski učinak autosomno recesivnih mutacija, bilo složena heterozigotna ili homozigotna, u genu SLC22A5 je sistemski primarni nedostatak karnitina, karakterizirana je smanjenim transportom karnitina, gubitkom karnitina u urinu, niskim koncentracijama karnitina u serumu, smanjenom unutarćelijskom akumulacijom karnitina, smanjenom beta-oksidacijom i citosolnim masnimm kiselinama. Pacijenti često pokazuju metaboličku dekompenzaciju, hipoketonsku hipoglikemija, jetrenu encefalopatiju, Reyeov sindrom i iznenadnu smrt novorođenčadi u prvoj godini, nakon čega jeslijedi kasniji početak kardiomiopatija ili skeletnih miopatija, aritmije, slabost mišića i zatajenje srca u ranom djetinjstvu.
Pacijenti mogu biti asimptomski, pri čemu oko 70% takvih pacijenata ima misens mutacije ili delecije; učestalost nonsens mutacija je povećana kod simptomskih pacijenata. Simptomi i ishod bolesti mogu se drastično poboljšati zamjenskom terapijom, uzimanjem L-karnitina. Procijenjena incidencija primarnog nedostatka karnitina u novorođenčadi je oko 1/40.000.
Interakcije SLC22A5 ima interakcije sa PDZK1.
Također pogledajte Rastvorni nosač
References
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Primary Carnitine Deficiency (OCTN2 database)
Kategorija:Porodica rastvornih nosača Kategorija:Amfetamin Kategorija:Geni na hromosomu 5 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika