Opće fragilno mjesto afidikolinskog tipa fra(3) (p24.2) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FRA3A sa hromosoma 3.
Funkcija Većinu anaerobnih infekcija kod ljudi uzrokuje Bacteroides fragilis. Prisustvo ostrva patogenosti u genomu razlikuje patogene i komensalne sojeve B. fragilis. Ostrvo kodira metaloproteinazu II (MPII), potencijalni protein virulencije, jedan od tri homologna fragilizinska izozima (FRA; takođe nazvan toksin B. fragilis ili BFT). U jednoj studiji iz 2014., podnesen je izvještaj o biohemijskim pokazateljima strukturno-funkcionalnih karakteristikama otoka proteazne patogenosti B. fragilis i kristalnoj strukturi MPII pri rezoluciji 2,13 Å, u kombinaciji s detaljnom karakterizacijom preferencija cijepanja MPII i FRA3 (kao predstavnika izoforme FRA)d. Identificirani su korištenjem testa cepanja peptida velike propusnosti sa 18.583 supstratnih peptida. Predlaženo je da se evolucija MPII katalitskog domena može pratiti do ljudskih i arhebakterijskih proteinaza, dok je za MPII i FRA specifična nabrani prodomen.
Zaključeno je da je katalitski domen i MPII i FRA3 evoluirao različito u odnosu na prodomen, i da je prodomen evoluirao specifično, kako bi odgovarao patogenosti B. fragilis. Sve u svemu, dobijeni podaci pružaju uvid u evoluciju specifičnosti cijepanja i mehanizama aktivacije u virulentnim metaloproteinazama.Robert C Liddington, Piotr Cieplak, Igor A Kozlov, Alex Y Strongin (2014): Structural and functional diversity of metalloproteinases encoded by the Bacteroides fragilis pathogenicity island, FEBS J281(11): 2487-502; pmid: 24698179; pmcid: pmc4047133; doi: 10.1111/febs.12804
Reference
Kategorija:Geni na hromosomu 3 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika