PROSER1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom PROSER1 sa hromosoma 13.

Nomenklatura PROSER1 ima nekoliko alijasa: C13orf23, KIAA2032 i protein bogat prolinom i serinom 1.

Gen thumb|center|500px|Lokasija gena PROSER1 na hromosomu 13.

Lokacija PROSER1 nalazi se na negativnom (obrnutom) lancu hromosoma 13 na poziciji 13q13.3. Proteže se od 39,009.865 baznih parova od ptera do 39,038.095 bp od ptera, sa veličinom od 28.231 baze U neprerfađenom primarnom traskriptu PROSER1 ima ukupno 13 egzona iRNK od 5,185 bp. Ima dvije izoforme, obje u rfasponu od 5.000 bp.

Gensko susjedstvo Geni STOML3 i NHLRC3 susedni su sa PROSER1 na hromosomu 13.

Tkivna distribucija thumb|center|500px| Dijagram nivoa ekspresije PROSER1 u različitim dijelovima ljudskog tijela. Mapiranje ekspresije ekspresije PROSER1 pokazuje da ima posebno visoku ekspresiju u limfnom, embrionskom tkivu, timusu i maternici. Ima umjerenu ekspresiju u sjemenicima, larinksu, nervima, krvi i mjestima masnog tkiva. Prema Atlasu ljudskih proteina, PROSER1 ima opću citoplazmatsku ekspresiju i eksprimiran je u svim kategorijama tkivne RNK.

Homologija Paralozi PROSER1 nema paraloge.

Ortolozi PROSER1 je visoko konzerviran među sisarima. Manje je konzerviran, iako je pronađen kod riba, ptica i nekih beskičmenjaka. Ne eksprimira se u bakterijama, biljkama ili gljivama. Prikaz ortologa u donjoj tabeli je prema NCBI-u. Rod i vrsta Uobičajeno ime Datiranje of divergencije (od H. sapiens) u milionima godina Prostupni broj Dužina proteinske sekvence (broj aminokiselina) Identitet sekvence Sličnost sekvence Homo sapiens Čovjek – NP_079414.3 944 – – Gorilla gorilla Gorila 8,9 XP_004054459 994 99% 99% Colobus angolensis palliatus Angolski kolobus 29,1 XP_011798372 947 97% 97%Nannospalax galili Spalaks 90.9 MYA XP_008847583 916 aa 80% 85% Cricetulus griseus Kineski hrčak 90.9 MYA XP_007626898 912 aa 79% 84% Panthera tigris altaica Sibirski tigar 975 XP_007097793 665 85% 89% Acinonyx jubatus Gepard 97,5 XP_014926409 770 79% 83% Tursiops truncatus Obični boconosi delfin 975 XP_004332367 1064 77% 83% Ornithorhynchus anatinus Kljunar 179,2 XP_007666895 888 69% 74% Chelonia mydas Zelena morska kornjača 320,5 XP_007070970 936 75% 83% Pygoscelis adeliae Adeli pingvin 320,5 XP_009318201 938 75% 83% Calidris (philomachus) pugnax Grgeč 320,5 XP_014821534 899 74% 83% Chrysemys picta bellii Obojena kornjača 320,5 XP_008175998 825 73% 82% Aquila chrysaetos canadensis Zlatni orao 320,5 XP_011579121 916 73% 81% Alligator sinensis Kineski aligator 320,5 XP_014376376 940 72% 81% Gekko japonicus Japanski gekon 320,5 XP_015281837 1053 65% 75% Python bivittatus Mjanmarski piton 320,5 XP_007438154 924 65% 75% Anolis carolinensis Karolinska anola 320,5 XP_008124125 920 64% 75% Xenopus tropicalis Zapadna kanžasta žaba 355,7 XP_012813331 944 51% 63% Lepisosteus oculatus Pjegava riba gar 429,6 XP_015197497 885 47% 58% Callorhinchus milii Australijska duh-ajkula 482,9 XP_007889503 965 64% 75%

Protein Opća svojstva Prevedeni PROSER1 protein ima 944 aminokiseline. Njegova predviđena molekulska težina je 95,7 kdal. PROSER1 ima izoelektričnu tački od 9, a nalazi se u jedru.

Kompozicija Sekvenca je bogata prolinom i serinom i nije posebno niska u bilo kojoj drugoj aminokiselini.

Domeni PROSER1 sadrži jedan domen nepoznate funkcije, DUF 4476, dio pfam14771. DUF se proteže od 26 do 26 121 aminokiseline. Molekulska težina DUF 4476 je 11,1 kdal. thumb|center|500px|Detalji lokacije DUF 4476 na PROSER1.

Sekundarna struktura aPROSER1 se sastoji prvenstveno od alfa-heliks, beta-listova i zavojnica. Protein je u velikoj mjeri umotan. DUF se sastoji uglavnom od alfa-heliksa i zavojnica. Ima nešto manje beta-listova u odnosu na protein u cjelini.

Reference

Kategorija:Geni na hromosomu 13 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika