RAD54-liki protein popravka i rekombinacije DNK jest protein koji je kod ljudi kodiran genom RAD54L' sa hromosoma 1.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 747 aminokiselina, a molekulska težina Da. 84 352
1020304050 MRRSLAPSQLAKRKPEGRSCDDEDWQPGLVTPRKRKSSSETQIQECFLSP FRKPLSQLTNQPPCLDSSQHEAFIRSILSKPFKVPIPNYQGPLGSRALGL KRAGVRRALHDPLEKDALVLYEPPPLSAHDQLKLDKEKLPVHVVVDPILS KVLRPHQREGVKFLWECVTSRRIPGSHGCIMADEMGLGKTLQCITLMWTL LRQSPECKPEIDKAVVVSPSSLVKNWYNEVGKWLGGRIQPLAIDGGSKDE IDQKLEGFMNQRGARVSSPILIISYETFRLHVGVLQKGSVGLVICDEGHR LKNSENQTYQALDSLNTSRRVLISGTPIQNDLLEYFSLVHFVNSGILGTA HEFKKHFELPILKGRDAAASEADRQLGEERLRELTSIVNRCLIRRTSDIL SKYLPVKIEQVVCCRLTPLQTELYKRFLRQAKPAEELLEGKMSVSSLSSI TSLKKLCNHPALIYDKCVEEEDGFVGALDLFPPGYSSKALEPQLSGKMLV LDYILAVTRSRSSDKVVLVSNYTQTLDLFEKLCRARRYLYVRLDGTMSIK KRAKVVERFNSPSSPDFVFMLSSKAGGCGLNLIGANRLVMFDPDWNPAND EQAMARVWRDGQKKTCYIYRLLSAGTIEEKIFQRQSHKKALSSCVVDEEQ DVERHFSLGELKELFILDEASLSDTHDRLHCRRCVNSRQIRPPPDGSDCT SDLAGWNHCTDKWGLRDEVLQAAWDAASTAITFVFHQRSHEEQRGLR
Funkcija Protein kodiran ovim genom pripada natporodici helikaza nalik DEAD-u i dijeli sličnost sa Rad54Saccharomyces cerevisiae, proteinom za koji se zna da je uključen u homolognu rekombinaciju i popravku DNK. Pokazalo se da ovaj protein ima ulogu u popravljanju dvolančanih prekida DNK, povezanih s homolognom rekombinacijom. Vezanje ovog proteina za dvolančanu DNK izaziva topološku njenu promjenu, za koju se smatra da olakšava homologno uparivanje DNK i stimulira rekombinaciju DNK.
Uvod u RAD54 RAD54 je jedan od ključnih proteina neophodnih za homolognu rekombinaciju i popravku DNK u mnogim organizmima. Bez funkcionalnog RAD54, vjerovatniji je razvoj tumora. RAD54 je prvobitno opisan u pupajućem kvascu Saccharomyces cerevisiae'' kao član evolucijski konzervirane RAD52 grupe epistaza, koja dodatno uključuje faktore RAD51, RAD52, RAD55 i RAD57. Vjeruje se da je ova grupa uključena u događaje rekombinacije DNK i mehanizme popravke, posebno one koji uključuju dvolančane prekide DNK tokom mitoze i mejoza. Nedavno je otkriven ljudski homolog kvasca RAD54 i nazvan je hRAD54.
Ljudski RAD54 (hRAD54) Ljudski RAD54 ili hRAD54, vezan je za hromosomsku regiju 1p32. Kodira protein, sastavljen od 747 aminokiselina, koji je 52% identičan kvašćevom. Ova dva proteina također dijele mnoge funkcionalne sličnosti. Proizvod kodiran RAD54 je član porodice proteina Swi2/Snf2, član potporodice Swi2/Snf2 ATPaza. Ovi proteinski proizvodi imaju homologiju u sedam očuvanih motiva helikaze. Pokazalo se da pročišćeni hRAD54 specifično pokazuje aktivnosti ATPaze zavisne od DNK i aktivnosti superspirale. Transkripti hRAD54 su eksprimirani prvenstveno u sjemenicima i timusu, a niži nivoi se nalaze i u tankom crijevu, debelom crijevu, dojkama i prostati. Mutanti hRAD54 su izuzetno osjetljivi na rendgenske zrake, kao i na metil-metansulfonat (MMS). Ovi mutanti su najvjerovatnije defektni i u spontanoj i u induciranoj mitotskoj rekombinaciji.
Akcije hRAD54 Interakcija između RAD54 i RAD51, još jednog člana grupe epistaza RAD52, kod ljudi posredovana je N-terminalnim domenom proteina hRAD54. Ovaj N-terminalni kraj stupa u interakciju sa slobodnim i vezanim krajevima RAD51 proteina. RAD54 kreće se duž lanca DNK, proizvodeći pozitivne superzavojnice ispred kretanja replikacije proteina i negativne superzavojnice koje prate kompleks. Interakcija sa RAD51 poboljšava sposobnost RAD54 da izvrši ovu aktivnost superspirale i napetog otvaranja. Ovi proteini također djeluju zajedno da formiraju DNK zglobove, pri čemu RAD54 specifično proširuje zglobove i stabilizuje formirane D-petlje. Alternativna funkcija RAD54 može biti uklanjanje proteina RAD51, nakon formiranja zglobova i inicijacije rekombinacije.
Inaktivacija hRAD54 i osjetljivost na rak Poznato je da su defekti u RAD51 povezani s razvojem tumora. Normalno, RAD51 stupa u interakciju sa proteinskim proizvodima BRCA1 i BRCA2 da izazove supresiju tumora. Ovo dovodi do pretpostavke da su drugi članovi grupe RAD52 epistaze, uključujući RAD54, takođe važni u razvoju i supresiji tumora zbog njihovog homolognog odnosa. Učešće RAD54 kao neophodnog rekombinacijskog proteina podržano je nalazom da postoje mutacije RAD54 u malom procentu proučavanih karcinoma dojke i debelog crijeva, kao i nekoliko limfoma.
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 1 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika