Transkripcijski regulator ATRX znan i kao ATP-ovisna helikaza ATRX, X-vezana helikaza II, ili X-vezani jedarni protein (XNP) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom ATRX sa hromosoma X.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 2.492 aminokiseline, a molekulska težina 282.586 Da.
1020304050 MTAEPMSESKLNTLVQKLHDFLAHSSEESEETSSPPRLAMNQNTDKISGS GSNSDMMENSKEEGTSSSEKSKSSGSSRSKRKPSIVTKYVESDDEKPLDD ETVNEDASNENSENDITMQSLPKGTVIVQPEPVLNEDKDDFKGPEFRSRS KMKTENLKKRGEDGLHGIVSCTACGQQVNHFQKDSIYRHPSLQVLICKNC FKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFCKKCILRNLGR KELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKV DSEKSNKVYEHTSRFSPKKTSSNCNGEEKKLDDSCSGSVTYSYSALIVPK EMIKKAKKLIETTANMNSSYVKFLKQATDNSEISSATKLRQLKAFKSVLA DIKKAHLALEEDLNSEFRAMDAVNKEKNTKEHKVIDAKFETKARKGEKPC ALEKKDISKSEAKLSRKQVDSEHMHQNVPTEEQRTNKSTGGEHKKSDRKE EPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIFENLETAMEVQSSVDHQGDGSS GTEQEVESSSVKLNISSKDNRGGIKSKTTAKVTKELYVKLTPVSLSNSPI KGADCQEVPQDKDGYKSCGLNPKLEKCGLGQENSDNEHLVENEVSLLLEE SDLRRSPRVKTTPLRRPTETNPVTSNSDEECNETVKEKQKLSVPVRKKDK RNSSDSAIDNPKPNKLPKSKQSETVDQNSDSDEMLAILKEVSRMSHSSSS DTDINEIHTNHKTLYDLKTQAGKDDKGKRKRKSSTSGSDFDTKKGKSAKS SIISKKKRQTQSESSNYDSELEKEIKSMSKIGAARTTKKRIPNTKDFDSS EDEKHSKKGMDNQGHKNLKTSQEGSSDDAERKQERETFSSAEGTVDKDTT IMELRDRLPKKQQASASTDGVDKLSGKEQSFTSLEVRKVAETKEKSKHLK TKTCKKVQDGLSDIAEKFLKKDQSDETSEDDKKQSKKGTEEKKKPSDFKK KVIKMEQQYESSSDGTEKLPEREEICHFPKGIKQIKNGTTDGEKKSKKIR DKTSKKKDELSDYAEKSTGKGDSCDSSEDKKSKNGAYGREKKRCKLLGKS SRKRQDCSSSDTEKYSMKEDGCNSSDKRLKRIELRERRNLSSKRNTKEIQ SGSSSSDAEESSEDNKKKKQRTSSKKKAVIVKEKKRNSLRTSTKRKQADI TSSSSSDIEDDDQNSIGEGSSDEQKIKPVTENLVLSSHTGFCQSSGDEAL SKSVPVTVDDDDDDNDPENRIAKKMLLEEIKANLSSDEDGSSDDEPEEGK KRTGKQNEENPGDEEAKNQVNSESDSDSEESKKPRYRHRLLRHKLTVSDG ESGEEKKTKPKEHKEVKGRNRRKVSSEDSEDSDFQESGVSEEVSESEDEQ RPRTRSAKKAELEENQRSYKQKKKRRRIKVQEDSSSENKSNSEEEEEEKE EEEEEEEEEEEEEEDENDDSKSPGKGRKKIRKILKDDKLRTETQNALKEE EERRKRIAEREREREKLREVIEIEDASPTKCPITTKLVLDEDEETKEPLV QVHRNMVIKLKPHQVDGVQFMWDCCCESVKKTKKSPGSGCILAHCMGLGK TLQVVSFLHTVLLCDKLDFSTALVVCPLNTALNWMNEFEKWQEGLKDDEK LEVSELATVKRPQERSYMLQRWQEDGGVMIIGYEMYRNLAQGRNVKSRKL KEIFNKALVDPGPDFVVCDEGHILKNEASAVSKAMNSIRSRRRIILTGTP LQNNLIEYHCMVNFIKENLLGSIKEFRNRFINPIQNGQCADSTMVDVRVM KKRAHILYEMLAGCVQRKDYTALTKFLPPKHEYVLAVRMTSIQCKLYQYY LDHLTGVGNNSEGGRGKAGAKLFQDFQMLSRIWTHPWCLQLDYISKENKG YFDEDSMDEFIASDSDETSMSLSSDDYTKKKKKGKKGKKDSSSSGSGSDN DVEVIKVWNSRSRGGGEGNVDETGNNPSVSLKLEESKATSSSNPSSPAPD WYKDFVTDADAEVLEHSGKMVLLFEILRMAEEIGDKVLVFSQSLISLDLI EDFLELASREKTEDKDKPLIYKGEGKWLRNIDYYRLDGSTTAQSRKKWAE EFNDETNVRGRLFIISTKAGSLGINLVAANRVIIFDASWNPSYDIQSIFR VYRFGQTKPVYVYRFLAQGTMEDKIYDRQVTKQSLSFRVVDQQQVERHFT MNELTELYTFEPDLLDDPNSEKKKKRDTPMLPKDTILAELLQIHKEHIVG YHEHDSLLDHKEEEELTEEERKAAWAEYEAEKKGLTMRFNIPTGTNLPPV SFNSQTPYIPFNLGALSAMSNQQLEDLINQGREKVVEATNSVTAVRIQPL EDIISAVWKENMNLSEAQVQALALSRQASQELDVKRREAIYNDVLTKQQM LISCVQRILMNRRLQQQYNQQQQQQMTYQQATLGHLMMPKPPNLIMNPSN YQQIDMRGMYQPVAGGMQPPPLQRAPPPMRSKNPGPSQGKSM
Funkcija Transkripcijski regulator ATRX sadrži domen ATPaza/helikaza i stoga pripada SWI/SNF porodici proteina hromatinskog remodeliranja. ATRX je neophodan za taloženje histonske varijante H3.3 na telomerama i drugih genomskih ponavljanja. Ove interakcije su važne za održavanje utišavanja na ovim lokusima.
Osim toga, ATRX prolazi kroz fosforilacije ovisno o ćelijskom ciklusu, koje reguliraju njegovu jedarnu matricu i asocijaciju hromatina, sugerirajući njegovu uključenost u regulaciju gena u interfazi i hromosomsku segregaciju u mitozi.
Klinički značaj
Naslijeđene mutacije
Naslijeđene mutacije gena ATRX povezane su sa X-vezanim sindromom mentalne retardacije (XLMR) sindromom koji je najčešće praćen alfa-talasemijjskim sindromom mentalne retardacije (sindrom ATR-X). Pokazalo se da ove mutacije uzrokuju različite promjene u obrascu metilacije DNK, što može potvrditi vezu između remodeliranja hromatina, metilacije DNK i ekspresije gena u razvojnim procesima. Zabilježeno je više alternativno prertađemih varijanti transkripta koje kodiraju različite izoforme. Žene nositeljice mogu pokazati iskrivljenu inaktivacija X hromosoma.
Somatske mutacije
Stečene mutacije u ATRX-u prijavljene su u brojnim ljudskim karcinomima, uključujući neuroendokrine tumore pankreasa, gliome, astrocitome, osteosarkome, i maligne feohromocitome. Postoji jaka korelacija između ATRX mutacija i fenotipa alternativne elongacije telomera (ALT) kod karcinoma.
Interakcije
ATRX formira kompleks sa DAXX koji je šaperon histona H3.3.
Također se pokazalo da ATRX ima interakcije sa EZH2.
Tgakođer pogledajte Sindrom alfa-talasemijske mentalne retardacije
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi GeneReviews/NCBI/NIH/UW entry on Alpha-Thalassemia X-Linked Mental Retardation Syndrome; ATRX Syndrome; Alpha Thalassemia/Mental Retardation, X-Linked; XLMR-Hypotonic Face Syndrome OMIM entries on Alpha-Thalassemia X-Linked Mental Retardation Syndrome
Kategorija:Geni na hromosomu X Kategorija:Enzimi Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika