FERM i PDZ sa domenom 3 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom FRMPD3 sa hromosoma X.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 1.810 aminokiselina, a molekulska težina 199.209 Da.
1020304050 METLDSQRVQDRLLAAPGCSSPSGQQELFSSHVMQEESANDMECEQLPAE ILRQVTVHRDPIYGFGFVAGSERPVVVRSVRPGGPSENKLLAGDQIVAIN EEDVSEAPRERLIELIRSAKEFIVLTVLHTHQSPKSAFISAAKKAKLRSN PVKVRFSEQVAVGETDAKMMKKEALLLIPNVLKVFLENGQIKSFTFDGRT TVKDVMLTLQDRLSLRFIEHFALVLEYAGPEQNHKFLLLQDKQPLAYVVQ RTHYHGMKCLFRISFFPKDPVELLRRDPAAFEYLYIQSRNDVIRERFGMD PKPEMLLGLAALHIYITVSATRPSQKISLKNVEKEWGLEPFLPPSLLQVI KEKNLRKSLSQQLKAHQTHPSCGTKGSAIQAKLQYLRILNELPTFTGVLF NTVGLDEKQSATTLLVGPRHGISHVIDLKTNLTTVLSEFSKISKIQLFRE NQGVARVETSIMDAKPLVLLMEWPEATNFACLIAGYCRLLLDSRKMVFSR PASQPLPPPMIKADYMHSAHRPVTGGHLGKKESSYVGSVGTSPRKSSRCT PPPADSELVSFCYLHMREQRKEQESRTDVNENLIFFEETRPRTKSDPTSK SSGQGYEVVPDDFDAASLDHEPCASRARSYTLDNSLGAEALNFYCDSCKA KLQEQLGPRKGGKPGSSRDNIVDLMSLPPPGSEEEEEEEDETTSLLPAIA APPPGFRDNSSDEDDPKRRAVQSQEQGRHLRGLLYDEIPVTLIDSVQTRT VRDHAQELDDALVSTLQALEALAASEDGPHPPPPQTAGLIVLATITPESS LDSGHETNSSELTDMSEMMSAMKQHQNTTYFLAQHLNKDSLLARKDLPFR IQSCAAQAVLTAPYSLGRPDPNPSLQPIATGQSPGPPGARRKLPQSEGQV QGERTYSLAVHPALSPQLSEQKNLSLLSPVPEDKGPGHTRAGLEMSLRAA TSSLSEEQVSELRDNLPKEVRLSPKLILDPKSSVTPAIISAALQQVVHNK SLVTAGGALGNPPSRGERRLEASMGRPEVSMMSSSASKNLKFKISPSAPE TSWNSQHQLGAEVSSSPRAPTGSRADSLHLSQQEDSLPVQNFPPKSYLLR TSRESVGKQATGEVAGKGGPVGGKPTLQKQGTISSQGEKAQLESTPKRSK LEETSLVPRATYPMALQSPSCQSRSHSPSCQPHGHSPSSQSRGQSPSCQP RGQSPLRSQAASRQVSTMPSRKLETTLNGAHSTSEGPAKPKSSRGPFRLR NLFSATFPTRQKKETDERQAQLQKVKQYELEFLEELLKPPSQGELPGTEY LQPPAPGRCSCQLRSSPVQQGPGMSREQRRSCDCKRICRGGRPQATQTPV PSLRGRERDRVLPSQRQPEAGPGVSLSSPINVQRIRSTSLESRECRSDPE SGVSCLTTCASGGECLGAPNYRKLMRRYSISELDQGDRASLTSDVYPHPP LGMLPREAKEVEASLPIALGPKSRSLESPTLGDPSYVQVAPETKGPRQMA VFSLPEEVYRKPAELDEDSESSKCCSIRYCFYYRKCDMADDASDGKDELS YSIPMKILPGMKLDEQVVPVVSRTLQVLDAATCSSSSPEASRTQEIDLRV STFEGSLAKINALRAHAYGLPDGFLAARLDTNELLTVLRQCVASPEARAP KPYVSQISEYKLELALKFKELRASCRRVANVDKSPTHMLAAITGSFQVLS SLIETFVRLVFIVRSEAQRQELLAKVEEVVRNYTFLLRAAEESTARNLNQ QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQVAAAAGAATEHPPGSPTSATVMST FTHSLKTLIK
Funkcija Nagase et al (2001) prikupili su informacije o kodirajućim sekvencama neidentifikovanih gena, u projekatu sekvenciranja klonova ljudskih cDNK koji kodiraju velike proteine. Predstavili su čitave sekvence od 100 klonova cDNK neidentificiranih ljudskih gena, nazvanih KIAA1776 i KIAA1780-KIAA1878, iz biblioteke cDNK frakcioniranih po veličini izvedene iz ljudskog fetusog mozga, cijelog mozga odrasle osobe, hipokampusa i amigdale. Većina klonova cDNK koji će biti u potpunosti sekvencionirani odabrani su kao cDNK za koje je pokazano da imaju potencijal kodiranja in vitro eksperimentima transkripcije/translacije, a neki klonovi su odabrani korištenjem kompjuterski potpomognute analize terminalnih sekvenci cDNK.
Tri od ovih klonova (fibrilin2/KIAA1776, MEGF10/KIAA1780 i MEGF11/KIAA1781) izolovana su kao geni koji kodiraju proteine sa više domena sličnih EGF-u skriningom motiv-zamka. Prosječna veličina inserata i odgovarajućih otvorenih okvira čitanja analiziranih klonova eDNK dostigla je 4,7 kb i 2,4 kb (odnosno 785 aminokiselinskih ostataka). Iz rezultata pretraživanja homologije i motiva u javnim bazama podataka određene su funkcionalne kategorije predviđenih genskih proizvoda 54 gena; 93% ovih predviđenih genskih proizvoda (50 genskih proizvoda) klasifikovano je kao proteini povezani sa ćelijskom signalizacijom/komunikacijom, upravljanjem nukleinskim kiselinama ili ćelijskom strukturom/pokretljivošću. Kako bi se prikupile dodatne informacije o ovim genima, njihovi profili ekspresije su također proučavani u 10 ljudskih tkiva, osam regija mozga, kičmene moždine, fetusnog mozga i fetusne jetre putem reverzne transkripcije spregnute lančane reakcije polimeraze, čiji su proizvodi kvantificirani enzimski povezanim imunosorbentnim esejem.T Nagase 1, M Nakayama, D Nakajima, R Kikuno, O Ohara (2001): Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res, 27;8(2):85-95; pmid: 11347906; doi: 10.1093/dnares/8.2.85.
Reference
Kategorija:Geni na hromosomu X Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika