Proces dekapiranja informacijske RNK uključuje hidroliza strukture 5' cap na RNK izlažući 5' monofosfat. Kod eukariota, ovaj 5' monofosfat je supstrat za 5' egzonukleazu Xrn1 i iRNK se brzo uništava. Postoje mnoge situacije koje mogu dovesti do uklanjanja poklopca, od kojih su neke razmotrene u nastavku.
Kod prokariota, primarni transkript iRNK prirodno posjeduje 5'-trifosfatnu grupu nakon bakterijske transkripcije; enzim RppH uklanja pirofosfatnu molekulu sa 5' kraja, pretvarajući 5'-trifosfat u 5'-monofosfat, pokrećući degradaciju iRNK pomoću ribonukleaza.
Translacija i raspadanje
Unutar ćelija postoji ravnoteža između procesa translacija i raspada iRNK. Poruke koje se aktivno prevode su vezane polisomima i eukariotski inicijacijski faktori eIF-4E i eIF-4G (kod eukariota). Ovo blokira pristup kapi enzima za dekapiranje DCP2 i štiti molekulu iRNK. U uslovima gladovanja nutritijenata ili virusnih infekcija, translacija može biti ugrožena i dekapiranje se stimuliše. Ova ravnoteža se ogleda u veličini i obilju citoplazmatskih struktura poznatih kao P-tijela.
Specifični putevi raspadanja
Postoji niz specifičnih puteva propadanja koji prepoznaju aberantne poruke i promoviraju njihovo uklanjanje. nonsens-posredovano propadanje iRNK prepoznaje preuranjene stop kodone i promoviše dekapiranje kao i propadanje egzosoma. Pokazalo se da određene klase miRNK stimulišu dekapiranje.
Reference
Kategorija:RNK