Nukleotidnovezujući oligomerizacijski receptori ili NOD-liki receptori (NLR-i) (poznati i kao nukleotid-obvezujuća ponavljanja bogata leucinom), su unutarćelijki senzori molekulski uzorci sa patogenom (pambovima) koji ulaze u ćeliju putem fagocitoza ili pora i molekulskih obrazaca oštećenja To su povezane sa ćelijskim stresom. Oni su tipovi receptora za prepoznavanje uzorka (PRRS), i imati ključne uloge u regulaciji urođenog imunskog odgovora. NLR-i mogu sarađivati sa receptori nalik na (TLR-e) i regulišu upalni i apoptozni odgovor. Pronađeni su u limfocitima, makrofagima, dendritskim ćelijama i također u nemunskim ćelijama, naprimjer u epitelnim. NLR-i su visoko konzervirani kroz evoluciju. Njihovi homolozi otkriveni su u mnogim različitim životinjskim vrstama (APAF1) a također i u biljnom carstvu (R-protein otporan na bolest).
Struktura NLR-i sadrže 3 domena – centralni Nacht (NBD - NBD - nukleotidni domen) domen, koji je zajednički za sve NLRS, većina NLR-a ima i C-terminalnu reprodukciju remen ( LRR) i varijabilnu N-terminalnu interakciju. Nacht domen posreduje sa samooligomerizacijom ovisnom o ATP-u i LRR osjeti prisustvo liganda. N-terminalni domen odgovoran je za homotipnu interakciju protein-protein i može se sastojati od domena regrutacije kaspaza (CARD), PYD), kiselog transakktivnog domena ili Inhibitor bakulovirusnog ponavlja] (BIR-i).
Nomenklatura i sistem Imena kao Caterpiller, kimnu, NALP, PAN, Nacht, Pypaf korišteni su za opisivanje porodice NLRS. Nomenklatura je ujedinjen od strane Odbora nomenklature gena HUGO: Porodica je karakterizirana kao NLR-I za pružanje opisa porodičnih značajki - NLR znači nukleotidno obvezujući domen i bogatstvo za vezanje koji sadrži porodicu gena.
Ovaj sIstem dijeli NLR-e u 4 potporodice, na osnovu tipa N-terminalnog domena:
NLRA (A za kisele transaktivne domene): CIITA NLRB (B za BIRS): NAIP NLRC (C za CARD): NOD1, NLRC3, NLRC3, NLRC4, NLRC5 NLRP (P za PYD): NLRP1, NLRP2, NLRP3, NLRP4, NLRP5, NLRP6 , NLRP7, NLRP8, NLRP9, NLRP10, NLRP11, NLRP12, NLRP13, NLRP14
Postoji i dodatni potporodični NLRX koji nema značajnu homologiju bilo kojem N-terminalnom domenu. Član ove potporodice je NLRX1.
S druge strane, NLR-ovi se mogu podijeliti u tri potporodice u pogledu njihovih filogenetskih odnosa: NOD-ovi: NOD1, NOD2, NOD3 (NLRC3), NOD4 (NLRC5), NOD5 (NLRX1), CIITA NLRP-i (ili NALP-i): NLRP1, NLRP2, NLRP3, NLRP4, NLRP5, NLRP6, NLRP7, NLRP8, NLRP9, NLRP10, NLRP11, NLRP12, NLRP13, NLRP14 IPAF: IPAF (NLRC4), NAIP
Potporodica NOD NOD-na potporodica uključuje NOD1, NOD2, NOD3, NOD4 sa CARD domenom, CIITA koji sadrže kisele transakcivatorske domene i NOD5 bez ikakvih N-terminalnih domena.
Signalizacija Dobro opisan receptori su NOD1 i NOD2. Njihovih ligandi prepoznavanje regrutuju oligomerizacijske interakcije domena NACHT i CARD sa serinom sa CARD-ovima sa kinaza RIP2 što dovodi do aktiviranja RIP2. RIP2 posreduje angažiranje kinaze TAK1 koja fosforilira i aktivira iκb kinazu. Aktivacija IBB kinaze rezultira fosforizacijom inhibitora IκB-a koji eksprimira NF-κb i njenu jedarnu translokaciju. NF-κb zatim aktivira ečspresiju upalnih citokina. Mutacije u NOD2 povezane su s Crohnovom bolešću ili Blauovim sindromom.
Ligandi NOD1 i NOD2 prepoznaju peptidoglikanske motive iz bakterijske ćelije koja se sastoji od N-acetilglokozamina i N-acetilmuramske kiseline. Ovi lanci šećera su unakrsni povezani peptidnim lancima koji se mogu osjetiti kimanjem. NOD1 prepoznaje molekulu koji se zove mezo-diaminopimelna kiselina (Mezo-DAP) Uglavnom se nalazi u Gram-negativnim bakterijama (naprimjer Helicobacter pylori , Pseudomonas aeruginosa). NOD2 proteini mogu osjetiti unutarćelijski muramil-dipeptid (MDP), tipski za bakterije poput Streptococcus pneumoniae ili Mycobacterium tuberculosis.
Potporodice NLRP-i i IPAF Potporodica NLRP-ova sadrži NLRP1-NLRP14 koji karakteriše prisustvo PYD domena. Potporodica IPAF ima dva člana - IPAF sa CARD domenom i NAIP s BIR domenom.
Signalizacija Potporodice NLRPS i IPAF uključene su u formiranje upala. Najbolji okarakterizirani upalni agens je NLRP3, aktivacija putem PAMP ili vlažnosti dovodi do oligomerizacije. pmid20303873 "/> pirinskog domena NLRS veže se na adapter proteina ASC (Pycard) putem Interakcije PY-PYD-a. ASC sadrži domene PY i CARD i povezuje NLR-ove na neaktivan oblik kaspaza 1 putem CARD domena. Sve ove interakcije protein-protein tvore kompleks pod nazivom upadne upale. Agregacija procaspaze-1 uzrokuje autoupalnost i formiranje aktivnog enzima. Kaspaza-1 važan je za proteolitsku obradu proupalnih citokina Il-1β i IL-18]. NLRP3 mutacije odgovorne su za autoupalnu bolest porodični hladni automatsko-upalni sindrom ili Muglek-Wellsov sindrom.
Ligandi Postoje tri dobro okarakterizirane upalna inflasoma - NLRP1, NLRP3 i IPAF. Formiranje NLRP3 inflamasoma mogu se aktivirati Pamps kao što su mikrobilni toksini (na primjer alfa-toksina Staphylococcus aureus) ili cijeli patogeni, naprimjer Candida slbicans, Saccharumyces cerevisiae Sendai virus, gripa. NLRP3 prepoznaje i vlažnost što ukazuje na stres u ćeliji. Molekula za opasnost može biti vanćelijski ATP, vanćelijska glukoza, mononatrijski uritešni (MSU) kristali, kalcij-pirofosfat dihidrat (CPPD), alumi ili iritantici okoliša - silijij, azbest, UV idritantici i nadražitelji kože. Prisutnost ovih molekula izaziva proizvodnju ROS i k + efluks. NLRP1 prepoznaje smrtonosni toksin iz Bacillus antracis i muramil-dipeptid. IPAF osjeća flagellin iz Salmonella zyphimurium , Pseudomonas aeruginosa , Listeria monocytogenes.
Također pogledajte Toliki receptor Inflamasom Rig-I-liki receptor
Reference
Vanjski linkovi PTHR14074 (filter for human)
Kategorija:Unutarćelijski receptori Kategorija:LRR proteini Kategorija:Receptori Kategorija:Imunološki sistem