Unutrašnje mjesto ulaska virusa hepatitisa C u ribosom

Unutašnje mjesto ulaska ribosoma virusa hepatitisa C, ili HCV IRES, je RNK struktura unutar Pet prim netranslatiranih regija (5'UTR) genoma HCV-a koja posreduje u inicijaciji translacije neovisnoj o kapi.

Translacija proteina većine eukariotskih iRK odvija se mehanizmom zavisnim od kape i zahtijeva povezivanje Met-tRNKiMet, nekoliko eukariotskih faktora inicijacije i GTP sa 40S ribosomskom podjedinicom, regrutaciju za 5' kapa i skeniranje duž 5'UTR-a kako bi se došlo do početnog kodona. Nasuprot tome, translacija iRNK virusa hepatitisa C (HCV) inicira se drugačijim mehanizmom od uobičajenog modela vezivanja 5' kape. Ovaj alternativni mehanizam se oslanja na direktno vezivanje ribosomske podjedinice 40S od strane interno mjesto ulaska ribosoma (IRES) u 5' UTR HCV RNK. HCV IRES usvaja složenu strukturu i može se značajno razlikovati od IRES elemenata identifikovanih kod pikornavirusa. Pokazalo se da se mali broj eukariotskih iRNK translatira putem internog ulaska ribosoma.

IRES struktura Smatra se da nukleotidi 1–40 HCV iRNK ne doprinose translaciji, već su neophodni za replikaciju genomska RNK. Ostatak HCV 5'-UTR-a sastoji se od tri domene, i to domena II-IV (domen I se nalazi na 5'-kraju mRNA).

Mehanizam djelovanja HCV IRES nezavisno veže dvije komponente eukariotskog mehanizma za inicijaciju translacije, multiproteinski faktor inicijacije eIF3 i 40S malu ribosomsku podjedinicu. Štaviše, veže se za 40S na takav način da je AUG inicijatorski kodon pozicioniran na P-mjestu ribosoma, tako da nije potrebno skeniranje ribosoma. Posljedično, faktori skeniranja eIF1 i eIF1A nisu neophodni za translaciju HCV-a, kao ni komponente eIF4F kompleksa (eIF4A, eIF4E i eIF4G) i eIF4B, koje su generalno potrebne za vezivanje iRNK i odmotavanje 5'UTR regije pet primarnih gena. Inicijatorska tRNA se isporučuje ili putem eIF2 ili, u stresnim uslovima kada je eIF2 inaktiviran, putem eIF2A, eIF2D ili moguće eIF5B, homologom prokariotskog proteina IF2.

Također pogledajze Eukariotska translacija Eukariotski inicijacijski faktor

Reference

Dodatni izvori

Vanjski linkovi *Rfam|id=RF00061|name=Hepatitis C virus internal ribosome entry site}}

Kategorija:RNK Kategorija:Zarazne bolesti Kategorija:Hepatitis Kategorija:Ribosomi